RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UPK3BQ9BT76 320 aa7.15□□□□□ -1.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 Q9H8V8 135 aa7.15□□□□□ -1.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.15□□□□□ -1.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A0A1W2PPQ1 181 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 H3BNG1 76 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 H7BYZ3 331 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ADAP1O75689 374 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CXCL2P19875 107 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RHOBP62745 196 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CLINT1Q14677 625 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRIM63Q969Q1 353 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 Q9H3A6 140 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 H3BP45 60 aa7.13□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HOXB5P09067 269 aa7.13□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LINC00869P0C866 280 aa7.13□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPP1R1AQ13522 171 aa7.13□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.13□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.13□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.13□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.13□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.13□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR5G3P0C626 314 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 M6PRP20645 277 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DLK1P80370 383 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LCN15Q6UWW0 184 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SMIM8Q96KF7 97 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UHRF2Q96PU4 802 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SMCO3A2RU48 225 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 H3BMQ9 156 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HTN1P15515 57 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TEPPQ6URK8 271 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PATE2Q6UY27 113 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC190Q86UF4 302 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MCFD2Q8NI22 146 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARV1Q9H2C2 271 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PSENENQ9NZ42 101 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 V9GYH0 126 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYCBP2O75592 4640 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C9orf170A2RU37 121 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HOXA5P20719 270 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TAS2R30P59541 319 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR5I1Q13606 314 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ESRGQ1W209 222 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PYDC2Q56P42 97 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C18orf15Q96N68 181 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ODF3Q96PU9 254 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GGACTQ9BVM4 153 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARL6Q9H0F7 186 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SNURFLB1AK76 121 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TSC22D2O75157 780 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RLN2P04090 185 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KRTAP10-2P60368 255 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIR3DS1Q14943 382 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF546Q86UE3 836 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GOSR2O14653 212 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AGPAT2O15120 278 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SSSCA1O60232 199 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCNKO75909 580 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGLC2P0DOY2 106 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.07□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A0A0J9YY99 117 aa7.07□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GAGE12BA1L429 117 aa7.07□□□□□ -1.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRAC2D3DTV9 90 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms