RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451997.5

SH3BP1-203, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 3,123 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-203ENST00000451997 TMEM133Q9H2Q1 129 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-203ENST00000451997 NBASA2RRP1 2371 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-203ENST00000451997 ZGRF1Q86YA3 2104 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP1-203ENST00000451997 HIGD1AQ9Y241 93 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP1-203ENST00000451997 LYZL1Q6UWQ5 148 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP1-203ENST00000451997 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP1-203ENST00000451997 INSIG2Q9Y5U4 225 aa10.01□□□□□ -0.81
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SH3BP1-203ENST00000451997 COL12A1Q99715 3063 aa9.97□□□□□ -0.81
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SH3BP1-203ENST00000451997 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP1-203ENST00000451997 HLA-DMBP28068 263 aa9.96□□□□□ -0.82
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SH3BP1-203ENST00000451997 C1orf185Q5T7R7 199 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP1-203ENST00000451997 NGBQ9NPG2 151 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP1-203ENST00000451997 SPTA1P02549 2419 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-203ENST00000451997 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-203ENST00000451997 TWIST1Q15672 202 aa9.95□□□□□ -0.82
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