RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 CTDSPLO15194 276 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 PITX3O75364 302 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 HYPMO75409 117 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 CXCL3P19876 107 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00315P59091 139 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 PSG3Q16557 428 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PPQ1 181 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 PRSS46E5RG02 174 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 EREGO14944 169 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 HOXB5P09067 269 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 SPCS2Q15005 226 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 ESRGQ1W209 222 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 S100A7AQ86SG5 101 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 UPK3BQ9BT76 320 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 FAT1Q14517 4588 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 A0A087X0K7 114 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 SMIM18P0DKX4 95 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A6P12236 298 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 HOXA5P20719 270 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 ERVFC1-1P60608 527 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 KIR3DS1Q14943 382 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF503Q96F45 646 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 ARL6Q9H0F7 186 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 H3BTX0 84 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 SSSCA1O60232 199 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 LCN15Q6UWW0 184 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 MCFD2Q8NI22 146 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 PSENENQ9NZ42 101 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 CCNKO75909 580 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 SFT2D2O95562 160 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 SCGB1D2O95969 90 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 SELENOTP62341 195 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 PPP1R1AQ13522 171 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 Q5VSD8 79 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 Q6ZTI0 123 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 LRTM2Q8N967 370 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 FRZBQ92765 325 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 ARV1Q9H2C2 271 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 FABP12A6NFH5 140 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 SLC17A3O00476 420 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 SIVA1O15304 175 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 CXCL2P19875 107 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 LEPP41159 167 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 AP3S2P59780 193 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 PYDC2Q56P42 97 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 RNF24Q9Y225 148 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 MYCBP2O75592 4640 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 A0A096LPF7 62 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 PRAC2D3DTV9 90 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 H3BNG1 76 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 GOSR2O14653 212 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 COX7A2P2O60397 106 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 NXPH4O95158 308 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 IFNA5P01569 189 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 PLP1P60201 277 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 TEPPQ6URK8 271 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 PATE2Q6UY27 113 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV3-53P01767 116 aa7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-211ENST00000449757 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.07□□□□□ -1.28
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