RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444609.1

HDAC8-215, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC8, Length 607 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-215ENST00000444609 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 HOGA1Q86XE5 327 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 Q8N3U1 123 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 SLC25A22Q9H936 323 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 H3BMQ9 156 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 MYL12BO14950 172 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 PITX3O75364 302 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 CXCL3P19876 107 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 NEDD8Q15843 81 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 C14orf177Q52M58 125 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 GPR107Q5VW38 600 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 DUSP21Q9H596 190 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 GPR31O00270 319 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 ARL6IP5O75915 188 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 SFTA3P0C7M3 94 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 HSMCR30P0CW71 290 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 HRH1P35367 487 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 CCDC190Q86UF4 302 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 RMI2Q96E14 147 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 ZNF479Q96JC4 524 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 A0A087WYN8 130 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 ZFP92A6NM28 416 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 J3KRW8 73 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 IGKV1-5P01602 117 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 TAS2R20P59543 309 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 NOXA1Q86UR1 476 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 C7orf33Q8WU49 177 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 SLC35E1Q96K37 410 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 GPR82Q96P67 336 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 IFITM5A6NNB3 132 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 GGTLC3B5MD39 225 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 PTGES3LE9PB15 166 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 H7C1H1 209 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 TAAR5O14804 337 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 RGS10O43665 173 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 TEPPQ6URK8 271 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 DPH3Q96FX2 82 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 RNF185Q96GF1 192 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 FAM231BA6NCW3 169 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 CCSO14618 274 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 GABARAPO95166 117 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 FABP1P07148 127 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 S100ZQ8WXG8 99 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 YIPF6Q96EC8 236 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 DIABLOQ9NR28 239 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.31□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 ATG12O94817 140 aa6.31□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 SPCS3P61009 180 aa6.31□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 CTF1Q16619 201 aa6.31□□□□□ -1.4
HDAC8-215ENST00000444609 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.31□□□□□ -1.4
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