RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 C11orf71Q6IPW1 123 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 GATD1Q8NB37 220 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 IGFBPL1Q8WX77 278 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 S4R3C0 116 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 SPTBN2O15020 2390 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1B0GW15 77 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 ADORA2A-AS1P86434 159 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 TTC9CQ8N5M4 171 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 AAMDCQ9H7C9 122 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 LEPROTL1O95214 131 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 OR5AL1P0C617 328 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 TSPOP30536 169 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA12Q7Z6I5 190 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PRD5 423 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PRF3 423 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PRM7 423 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 CDSNQ15517 529 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 FBLN7Q53RD9 439 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 Q6AWC8 147 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 ARMS2P0C7Q2 107 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 OOSP1A8MZH6 123 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 IGLL1P15814 213 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 C21orf62Q9NYP8 219 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 THYN1Q9P016 225 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 CBY1Q9Y3M2 126 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD13-201ENST00000392539 M0R3E3 92 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 CT45A10P0DMU9 189 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 CRIP1P50238 77 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 KLRB1Q12918 225 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 OR4C46A6NHA9 309 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 F8W735 103 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 CSN1S1P47710 185 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 TFPI2P48307 235 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 PSG9Q00887 426 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 VMO1Q7Z5L0 202 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 ASCL2Q99929 193 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 Q8N6K4 173 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 ABCA4P78363 2273 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 NDPQ00604 133 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 STPG4Q8N801 248 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 UCNP55089 124 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 MINOS1Q5TGZ0 78 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00173Q6ZV60 143 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 SCGB2A1O75556 95 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 EBI3Q14213 229 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 DYNAPQ8N1N2 210 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 C8orf49Q96NF6 230 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 ORAOV1Q8WV07 137 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 TMUB1Q9BVT8 246 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 NDUFB8O95169 186 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 RPL7P18124 248 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF138P52744 262 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM191AQ9H0A3 160 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 ST20Q9HBF5 79 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 HSPB8Q9UJY1 196 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 PET117Q6UWS5 81 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM11P17152 192 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF493Q6ZR52 646 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM189A5PLL7 270 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 CSN3P07498 182 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 TPPP3Q9BW30 176 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 COX8CQ7Z4L0 72 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 DTX2Q86UW9 622 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 OR2T8A6NH00 312 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3-23P01764 117 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 RABAC1Q9UI14 185 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 LRBAP50851 2863 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 TACC2O95359 2948 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 AP5S1Q9NUS5 200 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 SH2D1AO60880 128 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 S100A7P31151 101 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 CEP295Q9C0D2 2601 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 CTSGP08311 255 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 RAXQ9Y2V3 346 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 HSBP1L1C9JCN9 74 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 LYZL1Q6UWQ5 148 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 FA2HQ7L5A8 372 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD13-201ENST00000392539 DCHS2Q6V1P9 2916 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms