RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 TNFSF8P32971 234 aa9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAUP35544 74 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3-201ENST00000373159 SELENOTP62341 195 aa9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3-201ENST00000373159 ID3Q02535 119 aa9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3-201ENST00000373159 S100A7AQ86SG5 101 aa9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3-201ENST00000373159 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3-201ENST00000373159 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
TRAPPC3-201ENST00000373159 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.07□□□□□ -0.96
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TRAPPC3-201ENST00000373159 KRTAP10-2P60368 255 aa9.06□□□□□ -0.96
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TRAPPC3-201ENST00000373159 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.04□□□□□ -0.96
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TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
TRAPPC3-201ENST00000373159 PSENENQ9NZ42 101 aa9.04□□□□□ -0.96
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TRAPPC3-201ENST00000373159 FNDC10F2Z333 226 aa9.03□□□□□ -0.96
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TRAPPC3-201ENST00000373159 LCN15Q6UWW0 184 aa9.03□□□□□ -0.96
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TRAPPC3-201ENST00000373159 GAGE12GP0CL81 117 aa9.02□□□□□ -0.97
TRAPPC3-201ENST00000373159 GAGE12IP0CL82 117 aa9.02□□□□□ -0.97
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TRAPPC3-201ENST00000373159 TEPPQ6URK8 271 aa9.01□□□□□ -0.97
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TRAPPC3-201ENST00000373159 MCFD2Q8NI22 146 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC3-201ENST00000373159 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.01□□□□□ -0.97
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TRAPPC3-201ENST00000373159 C9orf170A2RU37 121 aa9□□□□□ -0.97
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TRAPPC3-201ENST00000373159 OR10P1Q8NGE3 313 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC3-201ENST00000373159 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TRAPPC3-201ENST00000373159 GOSR2O14653 212 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRAPPC3-201ENST00000373159 TAS2R30P59541 319 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRAPPC3-201ENST00000373159 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF546Q86UE3 836 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3-201ENST00000373159 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3-201ENST00000373159 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC3-201ENST00000373159 C18orf15Q96N68 181 aa8.99□□□□□ -0.97
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