RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 C9JCJ5 164 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TCRAP04437 139 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 FAM209BQ5JX69 171 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 MYOZ3Q8TDC0 251 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 YPEL4Q96NS1 127 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ASCL2Q99929 193 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TUBA4BQ9H853 241 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 RNF152Q8N8N0 203 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 INAFM1C9JVW0 142 aa11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 MT-ND4LP03901 98 aa11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 CD99P14209 185 aa11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ELOBQ15370 118 aa11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ATG101Q9BSB4 218 aa11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 CLDN34H7C241 214 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 CXCL1P09341 107 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TAS2R60P59551 318 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM183BQ1AE95 376 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2E2Q96LR5 201 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM242Q9NWH2 141 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 KLF12Q9Y4X4 402 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 A0A087WW49 117 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 MGST1P10620 155 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 S100A7P31151 101 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 PDE6HQ13956 83 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 BAGE2Q86Y30 109 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 SFRP2Q96HF1 295 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 LY96Q9Y6Y9 160 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 IGLV2-11P01706 119 aa11.71□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 CRYBA1P05813 215 aa11.71□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 GALR1P47211 349 aa11.71□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2G1P62253 170 aa11.71□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 DEFB136Q30KP8 78 aa11.71□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 C1orf194Q5T5A4 169 aa11.71□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 GPHB5Q86YW7 130 aa11.71□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ANAPC16Q96DE5 110 aa11.71□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CASQ1-201ENST00000368078 DIRC3C9JPN6 131 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 H7BYZ3 331 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 HILS1P60008 231 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 PSG9Q00887 426 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 RPEL1Q2QD12 228 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 RNF182Q8N6D2 247 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf44Q8N8P7 122 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 GLMPQ8WWB7 406 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 CXorf65A6NEN9 183 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 GCGP01275 180 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 SCGB2A2Q13296 93 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 GPR82Q96P67 336 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 A0A087X0K7 114 aa11.69□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11.69□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 PRNTQ86SH4 94 aa11.69□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 DUX3Q96PT4 197 aa11.69□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 SYNJ2BPP57105 145 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 ERVFC1-1P60608 527 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 LINC01006Q8NI28 216 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 FMC1Q96HJ9 113 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 PRAC2D3DTV9 90 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 HAX1O00165 279 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 CHEK1O14757 476 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 LTAP01374 205 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 SMPXQ9UHP9 88 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 PRELID1Q9Y255 219 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-201ENST00000368078 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms