RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 PYYP10082 97 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 C4BPBP20851 252 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 ID1P41134 155 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 DEFB131AP59861 70 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 C16orf92Q96LL3 132 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 HRH4Q9H3N8 390 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 COL7A1Q02388 2944 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 PSMG4Q5JS54 123 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC51BQ86UW2 128 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 CITED4Q96RK1 184 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 OR51M1Q9H341 326 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 RPRMQ9NS64 109 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 H3BQ15 152 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 OR7C2O60412 319 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 GUK1Q16774 197 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF503Q96F45 646 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 PAXXQ9BUH6 204 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC17A3O00476 420 aa14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF124Q15973 351 aa14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-202ENST00000319107 DNAH9Q9NYC9 4486 aa14.96□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 H3BTX0 84 aa14.95□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF253O75346 499 aa14.95□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 STAG3L2P0CL84 134 aa14.95□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 STAG3L3P0CL85 134 aa14.95□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 PDE6HQ13956 83 aa14.95□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.95□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 RAB24Q969Q5 203 aa14.95□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 FXYD5Q96DB9 178 aa14.95□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 TUBA4BQ9H853 241 aa14.95□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.94□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 UMAD1C9J7I0 102 aa14.94□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 OR10J4P0C629 311 aa14.94□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa14.94□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF726P1Q15940 193 aa14.94□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 SSX7Q7RTT5 188 aa14.94□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 RNF141Q8WVD5 230 aa14.94□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 TMED6Q8WW62 240 aa14.94□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 C20orf173Q96LM9 149 aa14.94□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 LINC00052Q96N35 136 aa14.94□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.94□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.93□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.93□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.93□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 RNF182Q8N6D2 247 aa14.93□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.92□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.92□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 BLNKQ8WV28 456 aa14.92□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 KNCNA6PVL3 124 aa14.91□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 NDUFB4O95168 129 aa14.91□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 HLA-DMBP28068 263 aa14.91□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.91□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.91□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 CXorf1O96002 111 aa14.9□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 PSG9Q00887 426 aa14.9□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 PSG3Q16557 428 aa14.9□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.9□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.9□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.9□□□□□ -0.02
RALGPS1-202ENST00000319107 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 HLA-DRB4P13762 266 aa14.89□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 GCHFRP30047 84 aa14.89□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 FHITP49789 147 aa14.89□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 DEFB1P60022 68 aa14.89□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.89□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 STHQ8IWL8 128 aa14.89□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF738Q8NE65 137 aa14.89□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.89□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 AGRNO00468 2067 aa14.89□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.88□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.88□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.88□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.88□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.88□□□□□ -0.03
RALGPS1-202ENST00000319107 A0A0J9YX75 114 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms