RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 OR51M1Q9H341 326 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF253O75346 499 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 PYYP10082 97 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB131AP59861 70 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF503Q96F45 646 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 C16orf92Q96LL3 132 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 UMAD1C9J7I0 102 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 OR7C2O60412 319 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 STAG3L2P0CL84 134 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 STAG3L3P0CL85 134 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 PDE6HQ13956 83 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 PSMG4Q5JS54 123 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 RAB24Q969Q5 203 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 FXYD5Q96DB9 178 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 CITED4Q96RK1 184 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 PAXXQ9BUH6 204 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 SLC17A3O00476 420 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF726P1Q15940 193 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 RNF141Q8WVD5 230 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 H3BTX0 84 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFB4O95168 129 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 OR10J4P0C629 311 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 NBEAP1P0C6P0 100 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF124Q15973 351 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 SSX7Q7RTT5 188 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 TMED6Q8WW62 240 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 C20orf173Q96LM9 149 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 TUBA4BQ9H853 241 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00052Q96N35 136 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 CXorf1O96002 111 aa9.77□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 PSG9Q00887 426 aa9.77□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 PSG3Q16557 428 aa9.77□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.77□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 RNF182Q8N6D2 247 aa9.77□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 SUN5Q8TC36 379 aa9.77□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 BLNKQ8WV28 456 aa9.77□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.77□□□□□ -0.84
CCDC42-201ENST00000293845 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 HLA-DRB4P13762 266 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 HLA-DMBP28068 263 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 GCHFRP30047 84 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 FHITP49789 147 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 SULT1A2P50226 295 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 RAB5CP51148 216 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 B9D2Q9BPU9 175 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 PRELID1Q9Y255 219 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0J9YX75 114 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 KNCNA6PVL3 124 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB1P60022 68 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 STHQ8IWL8 128 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF738Q8NE65 137 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC42-201ENST00000293845 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms