RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 WDR81Q562E7 1941 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRB-201ENST00000261266 LYNX1P0DP58 116 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRB-201ENST00000261266 V9GYV3 84 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 FSTL3O95633 263 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV4-39P01824 125 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV2-5P01817 119 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 CDKN1BP46527 198 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM219Q86XT9 240 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 PRR25Q96S07 402 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1-16P04430 117 aa7.21□□□□□ -1.25
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