RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 TMED6Q8WW62 240 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 ID1P41134 155 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 PHYHIPLQ96FC7 376 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 C16orf92Q96LL3 132 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 TM2D3Q9BRN9 247 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 IGLC2P0DOY2 106 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 KNCNA6PVL3 124 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 H3BQ15 152 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 MIR17HGQ75NE6 70 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 C20orf173Q96LM9 149 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 LINC00052Q96N35 136 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 HRH4Q9H3N8 390 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 DEFB1P60022 68 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 IGFL4Q6B9Z1 124 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC25A2Q9BXI2 301 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 FUT9Q9Y231 359 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC25A39-201ENST00000225308 MBP02144 154 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 ACTL10Q5JWF8 245 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 TEX261Q6UWH6 196 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 LCN15Q6UWW0 184 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 ALKAL2Q6UX46 152 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM14CQ9P0S9 112 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC17A3O00476 420 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 M6PRP20645 277 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 GDF5OSQ5U4N7 250 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 STHQ8IWL8 128 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF182Q8N6D2 247 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa16.01■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 UMAD1C9J7I0 102 aa16■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 H3BTX0 84 aa16■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 PYYP10082 97 aa16■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 APOC4P55056 127 aa16■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 RAB2AP61019 212 aa16■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 RHOBP62745 196 aa15.99■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.99■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 OR10G4Q8NGN3 311 aa15.99■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 OR10G9Q8NGN4 311 aa15.99■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 OR10G7Q8NGN6 311 aa15.99■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 RPRMQ9NS64 109 aa15.99■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF586Q9NXT0 402 aa15.99■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF680Q8NEM1 530 aa15.98■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRC20Q8TCA0 184 aa15.98■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA25Q9BR10 227 aa15.98■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 F6UB75 175 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 H3BMM0 161 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 HLA-DRB4P13762 266 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 HLA-DMBP28068 263 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 GUK1Q16774 197 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM74A1Q5RGS3 127 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 FOXI2Q6ZQN5 318 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC50A1Q9BRV3 221 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 ZMAT4Q9H898 229 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 RETNQ9HD89 108 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 IFNA7P01567 189 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 SULT1A2P50226 295 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF503Q96F45 646 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 CSTL1Q9H114 145 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 TRBV19A0A075B6N1 114 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 RAB5CP51148 216 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM122CQ6P4D5 195 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 Q6ZWC4 215 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 RCHY1Q96PM5 261 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 OR51M1Q9H341 326 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 U3KQK5 164 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A0J9YX75 114 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1W2PPV4 95 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 UBE2CO00762 179 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 IFITM2Q01629 132 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 PSG3Q16557 428 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 DEFB135Q30KP9 77 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF141Q8WVD5 230 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 OR7C2O60412 319 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF253O75346 499 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 NDUFB4O95168 129 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 OR10J4P0C629 311 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 FHITP49789 147 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 PDE6HQ13956 83 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC25A39-201ENST00000225308 DPPA3Q6W0C5 159 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms