RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639809.1

SPIN3-229, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,118 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-229	ENST00000639809	SMCO1	Q147U7	214 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	SLC35E1	Q96K37	410 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	MED28	Q9H204	178 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	SOCS3	O14543	225 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	CCS	O14618	274 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	GOSR2	O14653	212 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	HOXB5	P09067	269 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	FCN2	Q15485	313 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	RYR1	P21817	5038 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	MUC4	Q99102	2169 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	GAMT	Q14353	236 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	S100A7	P31151	101 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	FXYD7	P58549	80 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	LYZ	P61626	148 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	TRGV9	Q99603	122 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	RBKS	Q9H477	322 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	PKD1	P98161	4303 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809		A0A0J9YX75	114 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809		A8MTW9	85 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	SLC25A6	P12236	298 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	GALR1	P47211	349 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	B2M	P61769	119 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	DAD1	P61803	113 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	RAB11A	P62491	216 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	ZNF90	Q03938	601 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	DOK5	Q9P104	306 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-229	ENST00000639809	C5orf51	A6NDU8	294 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	SIX6	O95475	246 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	CXCL3	P19876	107 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	BCAP31	P51572	246 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	GPR82	Q96P67	336 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	HTN3	P15516	51 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	H2BFS	P57053	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	DEFB1	P60022	68 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	THAP8	Q8NA92	274 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	OR1S1	Q8NH92	325 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	C16orf92	Q96LL3	132 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	PITX3	O75364	302 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	C2orf50	Q96LR7	162 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	MED6	O75586	246 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	TSPO	P30536	169 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	ASB13	Q8WXK3	278 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	NMES1	Q9C002	83 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809		F6UB75	175 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	IL15RA	Q13261	267 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	OR2F1	Q13607	317 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	AMTN	Q6UX39	209 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	ATG101	Q9BSB4	218 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	ZNF98	A6NK75	572 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	INS	P01308	110 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	RAP2B	P61225	183 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	ZNF575	Q86XF7	245 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPIN3-229	ENST00000639809	RSG1	Q9BU20	258 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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