RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636769.1

SCN2A-213, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, human

TSL 5

Gene SCN2A, Length 8,573 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCN2A-213	ENST00000636769	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	SEC16A	O15027	2179 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	IGLL5	B9A064	214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	CFC1	P0CG37	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	UCN	P55089	124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	PAX8	Q06710	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769		A0A087WX48	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	NDUFB8	O95169	186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	CTSB	P07858	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769		Q6P435	159 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	FXYD7	P58549	80 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SCN2A-213	ENST00000636769	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	LINC00473	A8K010	186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769		F8WEM9	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	RHOD	O00212	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769		A0A1W2PR77	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769		S4R3C0	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SPTB	P11277	2137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769		A0A0U1RRA0	63 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	CFHR2	P36980	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	ERCC8	Q13216	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	FOXI1	Q12951	378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769		H0YJW9	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	CCL21	O00585	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SPX	Q9BT56	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769		J3QQQ9	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	NDUFS7	O75251	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	CCL3L1	P16619	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769		Q6ZVH6	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SAP30	O75446	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	PSPN	O60542	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCN2A-213	ENST00000636769	NPC2	P61916	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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