RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 NXPH3O95157 252 aa13.3□□□□□ -0.28
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CLN3-241ENST00000635861 PRR20CP86479 221 aa13.3□□□□□ -0.28
CLN3-241ENST00000635861 PRR20DP86480 221 aa13.3□□□□□ -0.28
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CLN3-241ENST00000635861 LYZP61626 148 aa13.22□□□□□ -0.29
CLN3-241ENST00000635861 RPP30P78346 268 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CLN3-241ENST00000635861 SVBPQ8N300 66 aa13.22□□□□□ -0.29
CLN3-241ENST00000635861 THAP8Q8NA92 274 aa13.22□□□□□ -0.29
CLN3-241ENST00000635861 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CLN3-241ENST00000635861 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
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