RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625282.2

SPTAN1-210, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 4,102 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-210ENST00000625282 DKK2Q9UBU2 259 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 JPT1Q9UK76 154 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 EPDR1Q9UM22 224 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 IGLL5B9A064 214 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 AKAP6Q13023 2319 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TGFAP01135 160 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 PSMB2P49721 201 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TMPRSS3P57727 454 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 C1orf159Q96HA4 380 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 ERG28Q9UKR5 140 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 HBDP02042 147 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 PLCE1Q9P212 2302 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 CFHR2P36980 270 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 ASCL2Q99929 193 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM160Q9NX00 188 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 D6R8Y8 96 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 FOXI1Q12951 378 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 PINLYPA6NC86 204 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 C15orf61A6NNL5 157 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6ZUT4 128 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TSPAN13O95857 204 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 NBL1P41271 181 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 PRSS46E5RG02 174 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 IL4P05112 153 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 CEND1Q8N111 149 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 NPIPB3Q92617 1050 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 RAXQ9Y2V3 346 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 FNDC10F2Z333 226 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 M0R1B8 84 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 CKS2P33552 79 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 XGP55808 180 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 DPF1Q92782 380 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 C12orf74Q32Q52 190 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 PTH2Q96A98 100 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 KLRD1Q13241 179 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 Q8TCH9 128 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 FOXC2Q99958 501 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 GAGE2BQ13066 116 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF146Q15072 292 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 GAGE2EQ4V326 116 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 PIP4P1Q86T03 277 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 COQ2Q96H96 371 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 HCFC1P51610 2035 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 E9PLD3 99 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 SMKR1H3BMG3 65 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 SNCGO76070 127 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 METRNQ9UJH8 293 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 PRNDQ9UKY0 176 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 ABCA4P78363 2273 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 GAGE12JA6NER3 117 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 DNPH1O43598 174 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 GAGE7O76087 117 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 GAGE12FP0CL80 117 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 GAGE12GP0CL81 117 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 GAGE12IP0CL82 117 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-210ENST00000625282 CT45A10P0DMU9 189 aa7.28□□□□□ -1.24
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