RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609284.1

NUP50-AS1-203, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NUP50-AS1, Length 710 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-203ENST00000609284 F8W036 122 aa6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TCF21O43680 179 aa6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CRLF1O75462 422 aa6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR10J4P0C629 311 aa6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGLC2P0DOY2 106 aa6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ATP5G3P48201 142 aa6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 UBE2G2P60604 165 aa6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 METTL26Q96S19 204 aa6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 U3KQE9 123 aa6.93□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 A8MWP6 167 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CRYBB3P26998 211 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PDE6HQ13956 83 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CST9LP1Q5W188 147 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LEMD1Q68G75 181 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 REC114Q7Z4M0 266 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SVBPQ8N300 66 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR4F5Q8NH21 305 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GPR82Q96P67 336 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR4F4Q96R69 305 aa6.92□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 A0A087X0K7 114 aa6.91□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.91□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF253O75346 499 aa6.91□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 APOC3P02656 99 aa6.91□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MYCNOSP40205 109 aa6.91□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GUCA2BQ16661 112 aa6.91□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.91□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GPHB5Q86YW7 130 aa6.91□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LINC01006Q8NI28 216 aa6.91□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 STAB1Q9NY15 2570 aa6.91□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 K7EMT4 169 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BUB3O43684 328 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SNAPINO95295 136 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NPPCP23582 126 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MEOX2P50222 304 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RPEL1Q2QD12 228 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PARLQ9H300 379 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OTORQ9NRC9 128 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.9□□□□□ -1.3
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 A0A087WW49 117 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF727A8MUV8 499 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 H3BQ15 152 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LGALS9O00182 355 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NDUFB4O95168 129 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BMI1P35226 326 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GALR1P47211 349 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CEBPGP53567 150 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PROK1P58294 105 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C1QL4Q86Z23 238 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BLNKQ8WV28 456 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GLMPQ8WWB7 406 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR5B12Q96R08 314 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 Q9H3A6 140 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.89□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 JMJD1CQ15652 2540 aa6.88□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.88□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 A0A1W2PS18 150 aa6.88□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMEM213A2RRL7 107 aa6.88□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C9JCJ5 164 aa6.88□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PEX7O00628 323 aa6.88□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RHEBQ15382 184 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms