RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559259.1

MFGE8-210, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-210ENST00000559259 LCN15Q6UWW0 184 aa13.84□□□□□ -0.19
MFGE8-210ENST00000559259 IL34Q6ZMJ4 242 aa13.84□□□□□ -0.19
MFGE8-210ENST00000559259 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.84□□□□□ -0.19
MFGE8-210ENST00000559259 GRAMD2BQ96HH9 432 aa13.84□□□□□ -0.19
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM167BQ9NRX6 74 aa13.84□□□□□ -0.19
MFGE8-210ENST00000559259 PEMTQ9UBM1 199 aa13.84□□□□□ -0.19
MFGE8-210ENST00000559259 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.84□□□□□ -0.19
MFGE8-210ENST00000559259 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa13.83□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF320A2RRD8 509 aa13.83□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 DEFB136Q30KP8 78 aa13.83□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 PRR31Q5SQ13 230 aa13.83□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 MORN5Q5VZ52 161 aa13.83□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 ELOVL1Q9BW60 279 aa13.83□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 SCRT1Q9BWW7 348 aa13.83□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa13.83□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 MGAM2Q2M2H8 2515 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM213A2RRL7 107 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 LINC00862A6NCI5 91 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 CD5P06127 495 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 ARL14EPLP0DKL9 152 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 GP9P14770 177 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 GCHFRP30047 84 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 MEOX2P50222 304 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 SYNJ2BPP57105 145 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 OR4F17Q8NGA8 305 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 OR4F4Q96R69 305 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 OR51M1Q9H341 326 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 HRH4Q9H3N8 390 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 SMPXQ9UHP9 88 aa13.82□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 A0A1W2PRX2 142 aa13.81□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 OR7C2O60412 319 aa13.81□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 SLURP1P55000 103 aa13.81□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 NDUFA5Q16718 116 aa13.81□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 C16orf54Q6UWD8 224 aa13.81□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.81□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF503Q96F45 646 aa13.81□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 PAXXQ9BUH6 204 aa13.81□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 MANBALQ9NQG1 85 aa13.81□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 TRAV5A0A0B4J249 113 aa13.8□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 IFNA1P01562 189 aa13.8□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 GUK1Q16774 197 aa13.8□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 OR8I2Q8N0Y5 310 aa13.8□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 GLMPQ8WWB7 406 aa13.8□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa13.8□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 A0A087X0K7 114 aa13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 RAB19A4D1S5 217 aa13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 C2orf70A6NJV1 201 aa13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 M0QZ24 198 aa13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 IGLC2P0DOY2 106 aa13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 GALR1P47211 349 aa13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 PDE6HQ13956 83 aa13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 TM4SF20Q53R12 229 aa13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 FXYD5Q96DB9 178 aa13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.79□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 HELTA6NFD8 242 aa13.78□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 CHEK1O14757 476 aa13.78□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF253O75346 499 aa13.78□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 CBLN1P23435 193 aa13.78□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 LEMD1Q68G75 181 aa13.78□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 FAM210AQ96ND0 272 aa13.78□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa13.78□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 SMDT1Q9H4I9 107 aa13.78□□□□□ -0.2
MFGE8-210ENST00000559259 OVOL1O14753 267 aa13.77□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 APOHP02749 345 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 NBEAP1P0C6P0 100 aa13.77□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 CCL20P78556 96 aa13.77□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 SAMD13Q5VXD3 122 aa13.77□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 LYPD1Q8N2G4 141 aa13.77□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 DUX3Q96PT4 197 aa13.77□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 A0A1W2PRE2 83 aa13.76□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa13.76□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.75□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP13.75□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 CSN3P07498 182 aa13.75□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 PYYP10082 97 aa13.75□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 BCL2P10415 239 aa13.75□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 FOLR2P14207 255 aa13.75□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 UQCC3Q6UW78 93 aa13.75□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 TCEAL7Q9BRU2 100 aa13.75□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 CLEC5AQ9NY25 188 aa13.75□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 GNG13Q9P2W3 67 aa13.75□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 RBFOX3A6NFN3 312 aa13.74□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 PF4P02776 101 aa13.74□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 OR10J4P0C629 311 aa13.74□□□□□ -0.21
MFGE8-210ENST00000559259 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms