RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF815PA8K554 130 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 ARID1AO14497 2285 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 BATFQ16520 125 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 RASL10AQ92737 203 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 RNF183Q96D59 192 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 VAMP8Q9BV40 100 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 INAFM1C9JVW0 142 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 FHITP49789 147 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 IFITM2Q01629 132 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 CSTL1Q9H114 145 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 C22orf46C9J442 243 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 NDUFA7O95182 113 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 SMPXQ9UHP9 88 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRB-209ENST00000550857 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 C12orf57Q99622 126 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 PAX4O43316 350 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 Q6ZR03 302 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 ORMDL3Q8N138 153 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 POLEQ07864 2286 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 LDLRAD4O15165 306 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 CRLF1O75462 422 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM50AO95807 157 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 IGKV1D-12P01611 117 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 CDKN1BP46527 198 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 C16orf74Q96GX8 76 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 A6NDN8 102 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 SPINK4O60575 86 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 ERCC8Q13216 396 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 NTF4P34130 210 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 POU2AF1Q16633 256 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM12Q96EX1 92 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 VCYO14598 125 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 IER3P46695 156 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 C7orf71A4D174 169 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 ID3Q02535 119 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 PMS2P11Q13670 270 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 PTPRSQ13332 1948 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 FOLR2P14207 255 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 FABP4P15090 132 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 NPBQ8NG41 125 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 MUC21Q5SSG8 566 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3-48P01763 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 CENPWQ5EE01 88 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GVG6 124 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 GLMPQ8WWB7 406 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 CCL20P78556 96 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 SFTA2Q6UW10 78 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 Q6YL49 198 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRB-209ENST00000550857 NFE4Q86UQ8 179 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 XCL2Q9UBD3 114 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 SCN2AQ99250 2005 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 IGHG2P01859 326 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 DIRC3C9JPN6 131 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 LHBP01229 141 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 CD28P10747 220 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 RUNX1Q01196 453 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 PMCHL1Q16048 86 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 PRR13Q9NZ81 148 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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