RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548220.1

PTPRR-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRR, Length 1,374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 C3orf56Q8N813 242 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 MGST2Q99735 147 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM231Q9H6L2 316 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 SLC39A9Q9NUM3 307 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRR-207ENST00000548220 PEMTQ9UBM1 199 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRR-207ENST00000548220 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 SMCO3A2RU48 225 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 FAM74A7A6NL05 159 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 SEC14L6B5MCN3 397 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 M0QZ24 198 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 TSPAN4O14817 238 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 C8orf88P0DMB2 117 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 NPPCP23582 126 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 B2MP61769 119 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 RHOBP62745 196 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 GUCA2BQ16661 112 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 GUK1Q16774 197 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 RPEL1Q2QD12 228 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 TOMM20LQ6UXN7 152 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 C12orf54Q6X4T0 127 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 STPG3Q8N7X2 389 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 FAM213BQ8TBF2 198 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 RNF125Q96EQ8 232 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 METTL26Q96S19 204 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 CHRDL1Q9BU40 450 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 PBDC1Q9BVG4 233 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 GPR61Q9BZJ8 451 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 GNB4Q9HAV0 340 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 TRAV25A0A0B4J276 109 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 HBE1P02100 147 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 OR5G3P0C626 314 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 SFTA3P0C7M3 94 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 TAS2R45P59539 299 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRR-207ENST00000548220 TIGITQ495A1 244 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 C19orf35Q6ZS72 473 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 OR11H1Q8NG94 326 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 GRAMD2BQ96HH9 432 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 RAX2Q96IS3 184 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 VSIRQ9H7M9 311 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 ZMAT4Q9H898 229 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 RABAC1Q9UI14 185 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 HIGD1AQ9Y241 93 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 A0A087WW49 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 HELTA6NFD8 242 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 C9JQL5 133 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 BUB3O43684 328 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 IGHV3-11P01762 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 IGHV3-48P01763 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 IL4P05112 153 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 RPL7P18124 248 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 FHITP49789 147 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 PPT1P50897 306 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 KRTAP10-3P60369 221 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 RAB2AP61019 212 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 PDE6HQ13956 83 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM41BQ5BJD5 291 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 OR9G4Q8NGQ1 327 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM37Q8WXS4 190 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRR-207ENST00000548220 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.75□□□□□ -1.65
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