RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.81□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.81□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 TP53RKQ96S44 253 aa6.81□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.81□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 A0A0G2JRQ6 117 aa6.8□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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KDM5A-211ENST00000544777 OR5AC1P0C628 307 aa6.8□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 RND3P61587 244 aa6.8□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 OR2F1Q13607 317 aa6.8□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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KDM5A-211ENST00000544777 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.8□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.79□□□□□ -1.32
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KDM5A-211ENST00000544777 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.79□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.79□□□□□ -1.32
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KDM5A-211ENST00000544777 FAM219AQ8IW50 185 aa6.79□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 LRTM2Q8N967 370 aa6.79□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.79□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 SLC35E1Q96K37 410 aa6.79□□□□□ -1.32
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KDM5A-211ENST00000544777 KIR3DS1Q14943 382 aa6.78□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 SP6Q3SY56 376 aa6.78□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 NMSQ5H8A3 153 aa6.78□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.78□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
KDM5A-211ENST00000544777 VCXQ9H320 206 aa6.78□□□□□ -1.32
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KDM5A-211ENST00000544777 S100A7P31151 101 aa6.77□□□□□ -1.33
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KDM5A-211ENST00000544777 RCVRNP35243 200 aa6.77□□□□□ -1.33
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KDM5A-211ENST00000544777 PRO0255Q9UI72 69 aa6.77□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.77□□□□□ -1.33
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KDM5A-211ENST00000544777 COPZ2Q9P299 210 aa6.76□□□□□ -1.33
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KDM5A-211ENST00000544777 SRIP30626 198 aa6.75□□□□□ -1.33
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KDM5A-211ENST00000544777 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 CCDC190Q86UF4 302 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 LGI3Q8N145 548 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.75□□□□□ -1.33
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KDM5A-211ENST00000544777 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.75□□□□□ -1.33
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KDM5A-211ENST00000544777 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 B3GALNT1O75752 331 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3-53P01767 116 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 ORM2P19652 201 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 ASAH1Q13510 395 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 C8orf49Q96NF6 230 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.73□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.73□□□□□ -1.33
KDM5A-211ENST00000544777 E5RGE8 158 aa6.73□□□□□ -1.33
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