RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CCL13Q99616 98 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FAM231BA6NCW3 169 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 F2RL2O00254 374 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 PLXNB1O43157 2135 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 IGLC1P0CG04 106 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CD69Q07108 199 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 NRGNQ92686 78 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FXYD5Q96DB9 178 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 C7orf71A4D174 169 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 TOX4O94842 621 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FSTL3O95633 263 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 COL8A1P27658 744 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 UPK2O00526 184 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 COX7A2P2O60397 106 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 GPR183P32249 361 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 ARF6P62330 175 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 TMEM177Q53S58 311 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 SRRM5B3KS81 715 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FNDC10F2Z333 226 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CD5LO43866 347 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FAM106CPP0CH98 169 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CT45A6P0DMU7 189 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CT45A5P0DMU8 189 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CT45A7P0DMV0 189 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 NPIPB3Q92617 1050 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 ZANQ9Y493 2812 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 J3QW42 95 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 MGST3O14880 152 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CGB3P0DN86 165 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CGB7P0DN87 165 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 KIR2DS2P43631 304 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 C2orf83Q53S99 150 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 PGPA6NDG6 321 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FCN3O75636 299 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 APOA2P02652 100 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CD3EP07766 207 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 REG1BP48304 166 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FXYD7P58549 80 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 SMIM12Q96EX1 92 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 C1RLQ9NZP8 487 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 PRNDQ9UKY0 176 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 K7ERU9 68 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 MYCNOSP40205 109 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 MLST8Q9BVC4 326 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 EPDR1Q9UM22 224 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CGB1A6NKQ9 187 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 OVOL3O00110 214 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 ORM2P19652 201 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 WT1-ASQ06250 92 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 GAGE10A6NGK3 116 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 C17orf100A8MU93 164 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 H3BUT2 72 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 APELAP0DMC3 54 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 HTR1DP28221 377 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 RTL8BQ17RB0 113 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CR1LQ2VPA4 569 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 RAB37Q96AX2 223 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 ZNF714Q96N38 554 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.27□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms