RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 COX6CP09669 75 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 LIME1Q9H400 295 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF815PA8K554 130 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 CKS1BP61024 79 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 ID3Q02535 119 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 GFI1Q99684 422 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 ST20Q9HBF5 79 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 C5orf52A6NGY3 159 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 TAS2R60P59551 318 aa8.29□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 DANCRP0C864 163 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 WDR86Q86TI4 376 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00473A8K010 186 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 HLA-DQA1P01909 254 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 CXCL2P19875 107 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 CENPWQ5EE01 88 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF138P52744 262 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF524Q96C55 264 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 SLC25A20O43772 301 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 TBX15Q96SF7 602 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 RHODO00212 210 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 IFITM3Q01628 133 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 VAMP3Q15836 100 aa8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 TOMM40O96008 361 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV1-16P04430 117 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 VWC2Q2TAL6 325 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 VCX2Q9H322 139 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 GZMBP10144 247 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 FHITP49789 147 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 QRFPP83859 136 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 A6NJY4 79 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 FOLR2P14207 255 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 PSG3Q16557 428 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 RAB37Q96AX2 223 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 GAGE12BA1L429 117 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 GAGE7O76087 117 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 GAGE12FP0CL80 117 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 GAGE12GP0CL81 117 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 GAGE12IP0CL82 117 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 SS18Q15532 418 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 NUDT11Q96G61 164 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1W2PRE2 83 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB136Q30KP8 78 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 PSG8Q9UQ74 426 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GW15 77 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 PAX4O43316 350 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 OR11H2Q8NH07 326 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 VAMP8Q9BV40 100 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 PARLQ9H300 379 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 EPDR1Q9UM22 224 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 PAX9P55771 341 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 CTSZQ9UBR2 303 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 J3QR89 54 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 SPATA25Q9BR10 227 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GUT8 65 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 NMSQ5H8A3 153 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 PRR31Q5SQ13 230 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1W2PPI3 338 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms