RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606		A0A1B0GWB2	263 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	DEFB130B	P0DP73	79 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	DEFB130A	P0DP74	79 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	TSKU	Q8WUA8	353 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606		A0A0G2JRQ6	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606		Q6ZRM9	215 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606		U3KQA8	63 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	PPBP	P02775	128 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	TCRA	P04437	139 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF138	P52744	262 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606		F2Z2F3	143 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606		Q96MF0	132 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	TRGV9	Q99603	122 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ATE1-208	ENST00000540606	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	DEFB131A	P59861	70 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606		A0A0G2JMZ2	1700 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606		A0A1B0GV90	55 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606		G3V318	75 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	TTC32	Q5I0X7	151 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	NIT1	Q86X76	327 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	RNF182	Q8N6D2	247 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	USMG5	Q96IX5	58 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	QRFP	P83859	136 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606		A6NNC1	897 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	C15orf62	A8K5M9	175 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	FGF16	O43320	207 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	TSPAN13	O95857	204 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	LINC00158	P58513	81 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	CR1L	Q2VPA4	569 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	C1orf159	Q96HA4	380 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	TNFSF13	O75888	250 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	DPM2	O94777	84 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606		A0A1W2PPI3	338 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606		D6R8Y8	96 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606		Q6ZR03	302 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	GLRX5	Q86SX6	157 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	PROK2	Q9HC23	129 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606		J3QKU1	62 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	ATP6V0E1	O15342	81 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	HIST1H2BK	O60814	126 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	HIST1H2BO	P23527	126 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	HIST1H2BB	P33778	126 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	HIST1H2BD	P58876	126 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	HIST1H2BC	P62807	126 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	RNF114	Q9Y508	228 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	LINC00479	Q96M42	142 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	ANK1	P16157	1881 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF815P	A8K554	130 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	ASCL4	Q6XD76	172 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	DTX1	Q86Y01	620 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ATE1-208	ENST00000540606	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		10.75	□□□□□ -0.69

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