RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 RITA1Q96K30 269 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 RSG1Q9BU20 258 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 THYN1Q9P016 225 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 H0YJW9 148 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 RRHO14718 337 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 ZNF253O75346 499 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 IGLC2P0DOY2 106 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 IGLC3P0DOY3 106 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 IER3P46695 156 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 LCN12Q6JVE5 192 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 PDPNQ86YL7 162 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 ADMP35318 185 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 KIR2DS2P43631 304 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 BAXQ07812 192 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 AZU1P20160 251 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 SRPXP78539 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 FAM90A2PQ658T7 463 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 ATP6V0BQ99437 205 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 SIGMAR1Q99720 223 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 SLC25A22Q9H936 323 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 HSBP1O75506 76 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 CD1BP29016 333 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TAS2R30P59541 319 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 PSG5Q15238 335 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TMEM177Q53S58 311 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 ACTL10Q5JWF8 245 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 C19orf35Q6ZS72 473 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 OR1B1Q8NGR6 318 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 RAB37Q96AX2 223 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TMEM242Q9NWH2 141 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 SNURFLB1AK76 121 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 ATP6V0E1O15342 81 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 KBTBD11O94819 623 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 IGLV1-47P01700 117 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 DEFB136Q30KP8 78 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 OR10P1Q8NGE3 313 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 C19orf24Q9BVV8 132 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 NRN1Q9NPD7 142 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 SCGB2A1O75556 95 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 OR10J4P0C629 311 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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GGA3-202ENST00000538886 RPRMQ9NS64 109 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TOMM40O96008 361 aa6.99□□□□□ -1.29
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GGA3-202ENST00000538886 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 SNAI2O43623 268 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 ESDP10768 282 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 PSG9Q00887 426 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 Q6ZPA2 131 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.99□□□□□ -1.29
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GGA3-202ENST00000538886 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 PRNDQ9UKY0 176 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 PDZD2O15018 2839 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 LINC01548A6NM66 108 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 OOSP1A8MZH6 123 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 PDE6DO43924 150 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 LYL1P12980 280 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 MUC21Q5SSG8 566 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 Q6ZS46 218 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 AGMATQ9BSE5 352 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 IGSF23A1L1A6 192 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 J3QR89 54 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 ARL3P36405 182 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-202ENST00000538886 Q6YL49 198 aa6.98□□□□□ -1.29
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