RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529404.5

FADS3-208, Transcript of fatty acid desaturase 3, human

TSL 2

Gene FADS3, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS3-208	ENST00000529404	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404		A8MWL6	223 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404		Q8N6K4	173 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404		Q8N976	141 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	RNF24	Q9Y225	148 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404		A6NJY4	79 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	IGLC2	P0DOY2	106 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	AMT	P48728	403 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404		P01737	135 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	NHLH1	Q02575	133 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	EBI3	Q14213	229 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	TCF24	Q7RTU0	167 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	NIT1	Q86X76	327 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	GTSF1	Q8WW33	167 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404		A0A1W2PRD5	423 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404		A0A1W2PRF3	423 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404		A0A1W2PRM7	423 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	HES1	Q14469	280 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	TDRG1	Q3Y452	100 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	RNF125	Q96EQ8	232 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	FAM231B	A6NCW3	169 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404		A0A1W2PPR1	153 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404		M0QZK8	103 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	EREG	O14944	169 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	PMCH	P20382	165 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	HBB	P68871	147 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	ZZEF1	O43149	2961 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	IL4	P05112	153 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	NPS	P0C0P6	89 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	CAMP	P49913	170 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	NDP	Q00604	133 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	ARPC1A	Q92747	370 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	HLA-DRB1	P01911	266 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	MFAP4	P55083	255 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	KRTDAP	P60985	99 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF785	A8K8V0	405 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	RBX1	P62877	108 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	SIRPD	Q9H106	197 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	ABCA4	P78363	2273 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	DIRC3	C9JPN6	131 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	GNG7	O60262	68 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	CFAP161	Q6P656	301 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	VAMP8	Q9BV40	100 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FADS3-208	ENST00000529404	OVOL3	O00110	214 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404		S4R3C0	116 aa		11.9	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404	C3orf79	P0CE67	100 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404	S100A7A	Q86SG5	101 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404	LRBA	P50851	2863 aa		11.89	□□□□□ -0.51
FADS3-208	ENST00000529404	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51

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