RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 TMED3Q9Y3Q3 217 aa12.69□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 LYRM9A8MSI8 78 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 C16orf90A8MZG2 172 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 MED6O75586 246 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 SLC25A6P12236 298 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 LRTM2Q8N967 370 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 BPIFCQ8NFQ6 507 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 OR1B1Q8NGR6 318 aa12.68□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa12.67□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 FABP12A6NFH5 140 aa12.67□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 INSP01308 110 aa12.67□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 TNFSF8P32971 234 aa12.67□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 RNF182Q8N6D2 247 aa12.67□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 RAB2BQ8WUD1 216 aa12.67□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 GPR82Q96P67 336 aa12.67□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 ATG101Q9BSB4 218 aa12.67□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 WRBO00258 174 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 SYNGR2O43760 224 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 DEFB130BP0DP73 79 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 DEFB130AP0DP74 79 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 VAMP1P23763 118 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 TSPOP30536 169 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 RPP30P78346 268 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 BAP18Q8IXM2 172 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM147Q9BVK8 224 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 PLAC8L1A1L4L8 177 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 AZU1P20160 251 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 B2MP61769 119 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 FGL1Q08830 312 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 FCN2Q15485 313 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 SPANXN5Q5MJ07 72 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-215ENST00000515147 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 S100A7P31151 101 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 FAUP35544 74 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 TMBIM6P55061 237 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 AKR1C1Q04828 323 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 Q8N1X5 172 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 ZNRF2Q8NHG8 242 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa12.63□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 F5H768 121 aa12.63□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 H3BP45 60 aa12.63□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 H3BRN7 92 aa12.63□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 NUDT3O95989 172 aa12.63□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa12.63□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF738Q8NE65 137 aa12.63□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 TRIM63Q969Q1 353 aa12.63□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 BCL7BQ9BQE9 202 aa12.63□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 APOBP04114 4563 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa12.62□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 SFT2D2O95562 160 aa12.62□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 HOXB5P09067 269 aa12.62□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 PPP1R1AQ13522 171 aa12.62□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM144Q7Z5S9 345 aa12.62□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 TOMM5Q8N4H5 51 aa12.62□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa12.62□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 IL5P05113 134 aa12.61□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 ATP5G1P05496 136 aa12.61□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 ATP5G3P48201 142 aa12.61□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 AP3S2P59780 193 aa12.61□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa12.61□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 C6orf223Q8N319 242 aa12.61□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 LINC01587Q99440 93 aa12.61□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 CBY3A6NI87 242 aa12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 RPL7P18124 248 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 CXCL3P19876 107 aa12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 RAP2BP61225 183 aa12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 RHOBP62745 196 aa12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 PYDC2Q56P42 97 aa12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 TMEM256Q8N2U0 113 aa12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 OR8A1Q8NGG7 326 aa12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 MCFD2Q8NI22 146 aa12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 UHRF2Q96PU4 802 aa12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 HIGD1AQ9Y241 93 aa12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 LINC00588Q9Y4M8 146 aa12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 HERC1Q15751 4861 aa12.6□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 SMCO3A2RU48 225 aa12.59□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 H3BMQ9 156 aa12.59□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 HYPMO75409 117 aa12.59□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 HTN1P15515 57 aa12.59□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 CCL18P55774 89 aa12.59□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 TAS2R60P59551 318 aa12.59□□□□□ -0.39
ITGA3-215ENST00000515147 A0A087X0K7 114 aa12.58□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 PMS2P5A8MQ11 134 aa12.58□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 OR5G3P0C626 314 aa12.58□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 LINC00869P0C866 280 aa12.58□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 PLP1P60201 277 aa12.58□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP12.58□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 ID3Q02535 119 aa12.58□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 PSG3Q16557 428 aa12.58□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 RNF141Q8WVD5 230 aa12.58□□□□□ -0.4
ITGA3-215ENST00000515147 C16orf74Q96GX8 76 aa12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.9 ms