RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 APCSP02743 223 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CSN1S1P47710 185 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TPPP2P59282 170 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ASCL2Q99929 193 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 A8MWL6 223 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 SERF1AO75920 110 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 SRIP30626 198 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 MYCNOSP40205 109 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TCF24Q7RTU0 167 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 NEU1Q99519 415 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 H3BRN7 92 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP6V0E1O15342 81 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 NUPR1O60356 82 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 RHOGP84095 191 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 PRR31Q5SQ13 230 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 M0R3E3 92 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 SSTP61278 116 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 C15orf32Q32M92 178 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 Q8N6K4 173 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 NUP35Q8NFH5 326 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 G3V318 75 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 EBI3Q14213 229 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TPPP3Q9BW30 176 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 RABAC1Q9UI14 185 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ITPR1Q14643 2758 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 LY6EQ16553 131 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TSKUQ8WUA8 353 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF785A8K8V0 405 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 OVOL3O00110 214 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 GZMBP10144 247 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 PMCHP20382 165 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 NTF3P20783 257 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CLEC3BP05452 202 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CT45A10P0DMU9 189 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFA6Q01524 100 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 IQCJQ1A5X6 159 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CD33P20138 364 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 F2Z2F3 143 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 BMPR1BO00238 502 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 AMTP48728 403 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 Q86TA4 180 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 S100A7P31151 101 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 PSG8Q9UQ74 426 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01548A6NM66 108 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 GOSR1O95249 250 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 LTAP01374 205 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 PRB1P04280 392 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 CTSGP08311 255 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 PAFAH1B2P68402 229 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
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RABGEF1-208ENST00000510829 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 PKIAP61925 76 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV1-69P01742 117 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTDAPP60985 99 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 NRGNQ92686 78 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 OR5R1Q8NH85 324 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM12Q96EX1 92 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.63□□□□□ -1.03
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