RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	BANF1	O75531	89 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	SERPINA1	P01009	418 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	CXCL8	P10145	99 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	HLA-E	P13747	358 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	COX7C	P15954	63 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	HOXA6	P31267	233 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	GRINA	Q7Z429	371 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	OR4K15	Q8NH41	348 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	MUCL1	Q96DR8	90 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	PHB2	Q99623	299 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	MUC5AC	P98088	5654 aa		0.3	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	MDN1	Q9NU22	5596 aa		0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	PPY	P01298	95 aa		0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	OR10J4	P0C629	311 aa		0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	DYNLT3	P51808	116 aa		0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	REEP5	Q00765	189 aa		0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	SPINK9	Q5DT21	86 aa		0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	ZNF714	Q96N38	554 aa		0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		0.29	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	NFYB	P25208	207 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	RAB5C	P51148	216 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	SPATA45	Q537H7	98 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	S100A7A	Q86SG5	101 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	IFT20	Q8IY31	132 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	TEX37	Q96LM6	180 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	PRRT1	Q99946	306 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	ARL5A	Q9Y689	179 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	SI	P14410	1827 aa		0.28	□□□□□ -2.36
USP34-222	ENST00000498268	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	MGAM	O43451	1857 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	PTPRF	P10586	1907 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	NUPR2	A6NF83	97 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	PRH1	P02810	166 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	CST2	P09228	141 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	CTXN2	P0C2S0	81 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	KDELR1	P24390	212 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	ERVS71-1	P61550	626 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	NCALD	P61601	193 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	OR5AS1	Q8N127	324 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	LYSMD1	Q96S90	227 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		0.27	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	TET1	Q8NFU7	2136 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268		A0A087WSZ3	146 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268		A0A0D9SG42	100 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	NDUFC2	O95298	119 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	IGLV1-51	P01701	117 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	IFNA6	P05013	189 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	CRH	P06850	196 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	TMBIM6	P55061	237 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	FADD	Q13158	208 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	MNS1	Q8NEH6	495 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	HYLS1	Q96M11	299 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	MIA2	Q96PC5	1412 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		0.26	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	NUP98	P52948	1817 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268		G3V2T6	193 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	CD14	P08571	375 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	CXCL1	P09341	107 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	CYBA	P13498	195 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	SPINT3	P49223	89 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	KLRD1	Q13241	179 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	PATE2	Q6UY27	113 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	LRRC18	Q8N456	261 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	PPTC7	Q8NI37	304 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	CEP19	Q96LK0	163 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	SMR3A	Q99954	134 aa		0.25	□□□□□ -2.37
USP34-222	ENST00000498268	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37

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