RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 CEND1Q8N111 149 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 ZZEF1O43149 2961 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PR77 199 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 SCGB2A1O75556 95 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 DKK1O94907 266 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 GRPP07492 148 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 KLRD1Q13241 179 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 CITED1Q99966 193 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 MLST8Q9BVC4 326 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 A0A087WX48 190 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 M0QXV9 152 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 P01737 135 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 FCER1GP30273 86 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 SLC25A45Q8N413 288 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 PGPA6NDG6 321 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 D6R8Y8 96 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 NDUFS7O75251 213 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 FXYD5Q96DB9 178 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
VWA3B-220ENST00000495571 TACC2O95359 2948 aa6.84□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.84□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 GNG3P63215 75 aa6.84□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.84□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.84□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.84□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.84□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 HARBI1Q96MB7 349 aa6.84□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM213A2RRL7 107 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 FSTL3O95633 263 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 NXPH1P58417 271 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ERVK11-1P61568 191 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZQT7 251 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 PAXXQ9BUH6 204 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 CACNA1GO43497 2377 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 J3KRW8 73 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 PLP2Q04941 152 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 PAX8Q06710 450 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 EDDM3AQ14507 147 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 AMN1Q8IY45 258 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 DPF1Q92782 380 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 EPDR1Q9UM22 224 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 DNAJC13O75165 2243 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 E7EUB6 86 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 RRN3P1Q2M238 152 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 GGNQ86UU5 652 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 SPRY4Q9C004 299 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 CTSZQ9UBR2 303 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 LMO7DNF2Z398 122 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 LIFP15018 202 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 MYCNOSP40205 109 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 SSR4P51571 173 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00596Q86U02 117 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.82□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 J3QT63 122 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 HAX1O00165 279 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 GUSBP11Q6P575 273 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 PLCE1Q9P212 2302 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 C15orf61A6NNL5 157 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ZFAND5O76080 213 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 TNFRSF1AP19438 455 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 COL8A1P27658 744 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 PSMB2P49721 201 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 SPTBN2O15020 2390 aa6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms