RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 SSX6Q7RTT6 188 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 LYG2Q86SG7 212 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 LYPD6Q86Y78 171 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF676Q8N7Q3 588 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 NDNFQ8TB73 568 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CACNG8Q8WXS5 425 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 YIPF6Q96EC8 236 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF170Q96K19 258 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF714Q96N38 554 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 SPACA5Q96QH8 159 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 THTPAQ9BU02 230 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 C9orf16Q9BUW7 83 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TMED9Q9BVK6 235 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TTTY10Q9BZA0 68 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RGCCQ9H4X1 137 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 Q9H521 79 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IL20Q9NYY1 176 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MED31Q9Y3C7 131 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 IRGMA1A4Y4 181 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM183AA6NL82 134 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM210A6NLX4 147 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 C15orf65H3BRN8 121 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R129 80 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFB2O95178 105 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 NRASP01111 189 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HRASP01112 189 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 KRASP01116 189 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HMGN1P05114 100 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 INAFM2P0DMQ5 153 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SPI1P17947 270 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SRMP19623 302 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC6A1P30531 599 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 GNG10P50151 68 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 INSL3P51460 131 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 EDDM3BP56851 147 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 GABARAPL2P60520 117 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 AESQ08117 197 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TSPAN31Q12999 210 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SNCBQ16143 134 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 CEACAM21Q3KPI0 293 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM104BQ5XKR9 115 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 LPCAT4Q643R3 524 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 FAHD1Q6P587 224 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HEPN1Q6WQI6 88 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00299Q6ZSB3 139 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF664Q8N3J9 261 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5L1Q8NGL2 311 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR13D1Q8NGV5 346 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10AC1Q8NH08 325 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR8S1Q8NH09 359 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 CANT1Q8WVQ1 401 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 DERL3Q96Q80 235 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 BCL7BQ9BQE9 202 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF251Q9BRH9 671 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 RTL8AQ9BWD3 113 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC22A4Q9H015 551 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF492Q9P255 531 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC22A13Q9Y226 551 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ORC6Q9Y5N6 252 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00312Q9Y6C7 94 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GW64 132 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 NUPR2A6NF83 97 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 LEUTXA8MZ59 168 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF878C9JN71 531 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 G3V2T6 193 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFS5O43920 106 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFA3O95167 84 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 GADD45GO95257 159 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TNFAIP8O95379 198 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP6V1G2O95670 118 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2H2O95918 312 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HAND1O96004 215 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SERPINA1P01009 418 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 IGLV6-57P01721 117 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5AC1P0C628 307 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SEC11BP0C7V7 166 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HRES1P13985 223 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-DMAP28067 261 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HAAOP46952 286 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR12D2P58182 307 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 CDC42P60953 191 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 GNG3P63215 75 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP5G2Q06055 141 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ST3GAL4Q11206 333 aa1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.4 ms