RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489048.1

NEB-215, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEB, Length 2,738 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-215ENST00000489048 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 H3BRN7 92 aa8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 TOX4O94842 621 aa8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 CNTFRP26992 372 aa8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.7□□□□□ -1.02
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NEB-215ENST00000489048 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.69□□□□□ -1.02
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NEB-215ENST00000489048 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.69□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.69□□□□□ -1.02
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NEB-215ENST00000489048 IGKV1-17P01599 117 aa8.68□□□□□ -1.02
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NEB-215ENST00000489048 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.68□□□□□ -1.02
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NEB-215ENST00000489048 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 COTL1Q14019 142 aa8.67□□□□□ -1.02
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NEB-215ENST00000489048 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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NEB-215ENST00000489048 JKAMPQ9P055 326 aa8.66□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.66□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 A0A0G2JNJ9 132 aa8.66□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.66□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 PDE6HQ13956 83 aa8.66□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 Q9UFV3 132 aa8.66□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.65□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.65□□□□□ -1.02
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NEB-215ENST00000489048 H0Y8G0 127 aa8.65□□□□□ -1.03
NEB-215ENST00000489048 SIVA1O15304 175 aa8.65□□□□□ -1.03
NEB-215ENST00000489048 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.65□□□□□ -1.03
NEB-215ENST00000489048 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.65□□□□□ -1.03
NEB-215ENST00000489048 NCOR1O75376 2440 aa8.64□□□□□ -1.03
NEB-215ENST00000489048 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.64□□□□□ -1.03
NEB-215ENST00000489048 LY6LH3BQJ8 138 aa8.64□□□□□ -1.03
NEB-215ENST00000489048 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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