RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 SRIP30626 198 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 FXYD3Q14802 87 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 KLK9Q2XQG4 91 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZWC4 215 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 DTX2Q86UW9 622 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 RITA1Q96K30 269 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 FBXL15Q9H469 300 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 A1L4Q6 167 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 HIGD1CA8MV81 97 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 H3BRN7 92 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 COX6B1P14854 86 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 CSN1S1P47710 185 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 LYZP61626 148 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 RIGQ13278 110 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 LCE3BQ5TA77 95 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 Q8N3U1 123 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 GATD1Q8NB37 220 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 LINC01560Q8TB33 94 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 BLNKQ8WV28 456 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 CFHR4Q92496 578 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ATP6V0BQ99437 205 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 NEU1Q99519 415 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 NBASA2RRP1 2371 aa6.75□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 C19orf84I3L1E1 186 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 K7EIM0 57 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 TIMM23O14925 209 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 GNG7O60262 68 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 NDUFB8O95169 186 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 IGKV1-17P01599 117 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 COX7A1P24310 79 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 COL8A1P27658 744 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 TCL1AP56279 114 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 LINC00310P59036 64 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 RNF125Q96EQ8 232 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 LINC00479Q96M42 142 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.74□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 CHEK1O14757 476 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 PLAUP00749 431 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 FAM106CPP0CH98 169 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 CT45A10P0DMU9 189 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 IGLC2P0DOY2 106 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 CNTFRP26992 372 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 KRTDAPP60985 99 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 PSG3Q16557 428 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 PRR27Q6MZM9 219 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 Q86TA4 180 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 FAM168AQ92567 244 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ARPC1AQ92747 370 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GUT8 65 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 M0R2Z0 102 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 SPINK4O60575 86 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 BMI1P35226 326 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ARF6P62330 175 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 SLAQ13239 276 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 PSMG4Q5JS54 123 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 Q8N6K4 173 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.72□□□□□ -1.33
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