RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430081.5

OPTN-208, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 5

Gene OPTN, Length 848 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-208ENST00000430081 DOK5Q9P104 306 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 CBY3A6NI87 242 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SOCS3O14543 225 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 INSP01308 110 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 FABP1P07148 127 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 AP3S2P59780 193 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 KRTAP10-2P60368 255 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 V9GYH0 126 aa7.18□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.17□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 PITX3O75364 302 aa7.17□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 MEOX2P50222 304 aa7.17□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 RAB11AP62491 216 aa7.17□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 DLK1P80370 383 aa7.17□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.17□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 RNF141Q8WVD5 230 aa7.17□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 FAT1Q14517 4588 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 CCDC160A6NGH7 325 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 H3BP45 60 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 WRBO00258 174 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 PRM2P04554 102 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 HOXB5P09067 269 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 TSPOP30536 169 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 GALR1P47211 349 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 PPP1R1AQ13522 171 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 FCN2Q15485 313 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 TRGV9Q99603 122 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SLC25A22Q9H936 323 aa7.16□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 A0A1W2PPQ1 181 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 A8MTW9 85 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 EREGO14944 169 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SYNGR2O43760 224 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 MED6O75586 246 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SFT2D2O95562 160 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SLC25A6P12236 298 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 AKR1C1Q04828 323 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 AMTNQ6UX39 209 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 LRTM2Q8N967 370 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 THAP8Q8NA92 274 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 FRZBQ92765 325 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 C20orf173Q96LM9 149 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 LINC01587Q99440 93 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 RSG1Q9BU20 258 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 Q9H3A6 140 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.15□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 PRSS46E5RG02 174 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 NACAE9PAV3 2078 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 M0R2Z0 102 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 ADAP1O75689 374 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 ORM2P19652 201 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 AZU1P20160 251 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 S100A5P33763 92 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 OR5I1Q13606 314 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 UHRF2Q96PU4 802 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 SMCO3A2RU48 225 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 HTN1P15515 57 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 M6PRP20645 277 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 S100A7P31151 101 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 TAS2R60P59551 318 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 CCDC190Q86UF4 302 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 BAP18Q8IXM2 172 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 UPK3BQ9BT76 320 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.12□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.12□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.12□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 ZNF98A6NK75 572 aa7.12□□□□□ -1.27
OPTN-208ENST00000430081 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms