RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 C15orf62A8K5M9 175 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 TEX46H3BTG2 121 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 GNG7O60262 68 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLN5O75503 358 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPY1RP25929 384 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPBWR1P48145 328 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR4X1Q8NH49 305 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGKV1-17P01599 117 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 OPRK1P41145 380 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 DLK1P80370 383 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 SERF2P84101 59 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARL16Q0P5N6 197 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAB31Q13636 194 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 BTNL8Q6UX41 500 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMCO3A2RU48 225 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAB19A4D1S5 217 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 MPDU1O75352 247 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 MBP02144 154 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 FGF7P21781 194 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZRG5 221 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM210AQ96ND0 272 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 HRH4Q9H3N8 390 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 KMT2AQ03164 3969 aa8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 FNDC10F2Z333 226 aa8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 HBE1P02100 147 aa8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLC1P0CG04 106 aa8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 VWC2Q2TAL6 325 aa8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 UQCC3Q6UW78 93 aa8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMPXQ9UHP9 88 aa8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0J9YWU9 116 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRSS46E5RG02 174 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHEK1O14757 476 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 TSPAN4O14817 238 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 RND2P52198 227 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 AKR1C1Q04828 323 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIGITQ495A1 244 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 VSIRQ9H7M9 311 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 HERC2O95714 4834 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 H3BS24 57 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 YIF1AO95070 293 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR10J1P30954 320 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 APOC4P55056 127 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 TEPPQ6URK8 271 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPIPB3Q92617 1050 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC35E1Q96K37 410 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNF2Q99496 336 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 RSG1Q9BU20 258 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-202ENST00000428892 X6R8D5 127 aa8.04□□□□□ -1.12
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