RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 H3BRN7 92 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFB6O95139 128 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1109Q2LD37 5005 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 PMS2P5A8MQ11 134 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 ADAP1O75689 374 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 PLP1P60201 277 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 RRN3P1Q2M238 152 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 PKHD1P08F94 4074 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 FNDC10F2Z333 226 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 SELENOTP62341 195 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 PSENENQ9NZ42 101 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 IL5P05113 134 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 RAP2BP61225 183 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM8Q96KF7 97 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GVY2 172 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 K7EPK0 472 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 IFNA21P01568 189 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 OR4E1P0C645 316 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 INPP1P49441 399 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 B2MP61769 119 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 DLK1P80370 383 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 BAK1Q16611 211 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 TRIQKQ629K1 86 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 S100A7AQ86SG5 101 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087X0K7 114 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SMCO3A2RU48 225 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SSSCA1O60232 199 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 HYPMO75409 117 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 INSP01308 110 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00869P0C866 280 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RNF24Q9Y225 148 aa14.89□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 TSPOP30536 169 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R30P59541 319 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RNF212Q495C1 297 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 LYRM9A8MSI8 78 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 BTCP35070 178 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 DAD1P61803 113 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RNF182Q8N6D2 247 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 PKD1P98161 4303 aa14.87□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 M0R2Z0 102 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RTL8CO15255 209 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 TSC22D2O75157 780 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 FGL1Q08830 312 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 TEPPQ6URK8 271 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF738Q8NE65 137 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.86□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 PCLOQ9Y6V0 5065 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 CENPXA8MT69 81 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 CCNKO75909 580 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 OR5G3P0C626 314 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 CXCL3P19876 107 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 C4orf46Q504U0 113 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZR54 194 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 UHRF2Q96PU4 802 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 GGACTQ9BVM4 153 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.85□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 HTN3P15516 51 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 CXCL2P19875 107 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 MITD1Q8WV92 249 aa14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.83□□□□□ -0.04
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