RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 REG4Q9BYZ8 158 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-205ENST00000419504 DOCK6Q96HP0 2047 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-205ENST00000419504 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TNS1-205ENST00000419504 SCN5AQ14524 2016 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-205ENST00000419504 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-205ENST00000419504 CST9LQ9H4G1 147 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-205ENST00000419504 C5orf63A6NC05 138 aa10.65□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 COL8A2P25067 703 aa10.65□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 ZNF492Q9P255 531 aa10.65□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 FCN3O75636 299 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 CSTL1Q9H114 145 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 ARID1AO14497 2285 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 MSRB2Q9Y3D2 182 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 GATA4P43694 442 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 UBE2E1P51965 193 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 JPT2Q9H910 190 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 LYPD2Q6UXB3 125 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 NDPQ00604 133 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 C11orf44Q8N8P7 122 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 SIGMAR1Q99720 223 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 SSC4DQ8WTU2 575 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 MEGF9Q9H1U4 602 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 E7EQL1 145 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 LMO1P25800 156 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 SAA4P35542 130 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 KLHDC3Q9BQ90 382 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 CRIM1Q9NZV1 1036 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 FAM231BA6NCW3 169 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 LEPROTO15243 131 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 LCNL1Q6ZST4 164 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 TET1Q8NFU7 2136 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 GUSBP1Q15486 140 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 SS18Q15532 418 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 Q8TAT8 98 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 ANAPC10Q9UM13 185 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 PAX4O43316 350 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 TMEM249Q2WGJ8 235 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 CT83Q5H943 113 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 ANAPC13Q9BS18 74 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 FHL1Q13642 323 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 TMEM158Q8WZ71 300 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 TMEM14BQ9NUH8 114 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 SFTA2Q6UW10 78 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 IGFL3Q6UXB1 125 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 MSMBP08118 114 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 GATD1Q8NB37 220 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 LY6G5BQ8NDX9 201 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 K7ENP7 123 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 RHODO00212 210 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 TIMM21Q9BVV7 248 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 A0A0G2JRQ6 117 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 RNF144BQ7Z419 303 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 A0A1W2PPI3 338 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 TMEM141Q96I45 108 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 C3orf79P0CE67 100 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 F8WEM9 126 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 LINC01619G3V211 115 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 PRSS46E5RG02 174 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 CDK2AP2O75956 126 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 IGKV1-16P04430 117 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 FXYD7P58549 80 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 C6orf226Q5I0X4 101 aa10.59□□□□□ -0.71
TNS1-205ENST00000419504 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 Q0VG73 95 aa10.58□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 IL17RELQ6ZVW7 336 aa10.58□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 LINC00311Q8N616 119 aa10.58□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 LIME1Q9H400 295 aa10.58□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 A0A0U1RRA0 63 aa10.58□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 J3QLI3 93 aa10.58□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa10.58□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 IGHV1-69P01742 117 aa10.58□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 NEGR1Q7Z3B1 354 aa10.58□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 ZNF581Q9P0T4 197 aa10.58□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 THADAQ6YHU6 1953 aa10.57□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa10.57□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 OVOL3O00110 214 aa10.57□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 IGHV3-53P01767 116 aa10.57□□□□□ -0.72
TNS1-205ENST00000419504 PFN1P07737 140 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms