RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.89□□□□□ -0.99
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PRAME-204ENST00000403441 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
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PRAME-204ENST00000403441 CELA1Q9UNI1 258 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-204ENST00000403441 PKHD1P08F94 4074 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GVY2 172 aa8.88□□□□□ -0.99
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PRAME-204ENST00000403441 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.88□□□□□ -0.99
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PRAME-204ENST00000403441 SULT1A1P50225 295 aa8.85□□□□□ -0.99
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PRAME-204ENST00000403441 H0YIZ8 118 aa8.84□□□□□ -0.99
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PRAME-204ENST00000403441 CAV2P51636 162 aa8.84□□□□□ -0.99
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PRAME-204ENST00000403441 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
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PRAME-204ENST00000403441 PATE2Q6UY27 113 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-204ENST00000403441 ZNF546Q86UE3 836 aa8.84□□□□□ -0.99
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PRAME-204ENST00000403441 GPR82Q96P67 336 aa8.84□□□□□ -0.99
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PRAME-204ENST00000403441 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.84□□□□□ -0.99
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PRAME-204ENST00000403441 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-204ENST00000403441 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 CST7O76096 145 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 SIX6O95475 246 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 ORM2P19652 201 aa8.83□□□□□ -1
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PRAME-204ENST00000403441 MEOX2P50222 304 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 S100A10P60903 97 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 NEU1Q99519 415 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 RFNGQ9Y644 331 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 A8MTW9 85 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 ISLRO14498 428 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 HYPMO75409 117 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
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