RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 C17orf77Q96MU5 243 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 H3BUA1 57 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 AP4M1O00189 453 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 SLC17A3O00476 420 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 TCRAP04437 139 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 TPPP2P59282 170 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 ERVFC1-1P60608 527 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 BAGE2Q86Y30 109 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.65□□□□□ -0.86
ZNF548-201ENST00000336128 BRI3O95415 125 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 TRGC2P03986 189 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 S100A7P31151 101 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 OR5R1Q8NH85 324 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 ATP6V0BQ99437 205 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 OSTCQ9NRP0 149 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 IL36BQ9NZH7 164 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 V9GYV3 84 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 FOXL1Q12952 345 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 PPP5D1E7EU14 171 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 TYMSP04818 313 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 S100A6P06703 90 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 RPL15P61313 204 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 FMC1Q96HJ9 113 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 SGK494Q96LW2 274 aa9.63□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 PF4V1P10720 104 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 CFHR3Q02985 330 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 Q6YL49 198 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF580Q9UK33 172 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 POLQO75417 2590 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 PTPN13Q12923 2485 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 PDE6HQ13956 83 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 RPEL1Q2QD12 228 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 USMG5Q96IX5 58 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 BTF3L4Q96K17 158 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.62□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF320A2RRD8 509 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV1-40P01703 118 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 ARL3P36405 182 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 Q86TA4 180 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 SMIM12Q96EX1 92 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 GPR82Q96P67 336 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 KLK15Q9H2R5 256 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 C5orf52A6NGY3 159 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 PHOX2AO14813 284 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 LTAP01374 205 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 FRZBQ92765 325 aa9.61□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 TRBV12-3P01733 135 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV3-11P01762 117 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 RAB9AP51151 201 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 PSG9Q00887 426 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 METTL26Q96S19 204 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 BUB3O43684 328 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 HIST1H2BKO60814 126 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV2-11P01706 119 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 HIST1H2BJP06899 126 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 TRGC1P0CF51 173 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 HIST1H2BOP23527 126 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 HIST1H2BBP33778 126 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 HIST1H2BDP58876 126 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-201ENST00000336128 HIST1H2BCP62807 126 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms