RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM126AQ9H061 195 aa0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 PSTPIP2Q9H939 334 aa0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 PARVBQ9HBI1 364 aa0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 HSPB8Q9UJY1 196 aa0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 PCTPQ9UKL6 214 aa0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 RNF11Q9Y3C5 154 aa0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 CFAP46Q8IYW2 2715 aa0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 MYH1P12882 1939 aa0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 PTPRDP23468 1912 aa0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 HELZP42694 1942 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 NUP210LQ5VU65 1888 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 TRPM7Q96QT4 1865 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 SBF2Q86WG5 1849 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 NF1P21359 2839 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 APCP25054 2843 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 ZANQ9Y493 2812 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF292O60281 2723 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 CENPEQ02224 2701 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 ITPR3Q14573 2671 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 STAB1Q9NY15 2570 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 UNC13CQ8NB66 2214 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 HAND1O96004 215 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 TCRBP04435 133 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 CD2P06729 351 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 UBE2BP63146 152 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 CDK6Q00534 326 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 LIN52Q52LA3 116 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 Q6ZS92 163 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 GRINAQ7Z429 371 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 Q8IYB0 196 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 OR10AG1Q8NH19 301 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 MUCL1Q96DR8 90 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 SIGMAR1Q99720 223 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 OR52A1Q9UKL2 312 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 SLC22A13Q9Y226 551 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 TEX15Q9BXT5 2789 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 HIVEP1P15822 2718 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 CHD6Q8TD26 2715 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 MYH7P12883 1935 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 MYH6P13533 1939 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 PATJQ8NI35 1801 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 KIF20BQ96Q89 1820 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 CACNA1EQ15878 2313 aa0.24□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 MXRA5Q9NR99 2828 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 ARHGEF11O15085 1522 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 DOCK11Q5JSL3 2073 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 NINQ8N4C6 2090 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 HECTD1Q9ULT8 2610 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 DOCK1Q14185 1865 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 DSPP15924 2871 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 PHIPQ8WWQ0 1821 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF236Q9UL36 1845 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 TRAV4A0A0B4J268 109 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM114B3SHH9 223 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 CST8O60676 142 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 CXCL8P10145 99 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 HLA-EP13747 358 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 SRIP30626 198 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 CDKN2CP42773 168 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 VBP1P61758 197 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 LSM6P62312 80 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 CCL7P80098 99 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 SPATA45Q537H7 98 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 TEX37Q96LM6 180 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 PLAC8Q9NZF1 115 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 LOC285556D6RIA3 1793 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 FREM3P0C091 2139 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 ESPL1Q14674 2120 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 TET1Q8NFU7 2136 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 TANC2Q9HCD6 1990 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 VWFP04275 2813 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 MYH8P13535 1937 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 MYH2Q9UKX2 1941 aa0.23□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.22□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 CECR2Q9BXF3 1484 aa0.22□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 ANK1P16157 1881 aa0.22□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa0.22□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 LAMB1P07942 1786 aa0.22□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 TRANK1O15050 2925 aa0.22□□□□□ -2.37
PDCL2-201ENST00000295645 NBEAQ8NFP9 2946 aa0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms