RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 NPSP0C0P6 89 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMPXQ9UHP9 88 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 PAX9P55771 341 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 C15orf32Q32M92 178 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6ZS49 121 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 E9PQ18 207 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-201ENST00000291574 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRGV9Q99603 122 aa11.11□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-201ENST00000291574 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGHV1-8P0DP01 117 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 COLCA1Q6ZS62 124 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM158Q8WZ71 300 aa11.11□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ASCL4Q6XD76 172 aa11.11□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-201ENST00000291574 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 C18orf32Q8TCD1 76 aa11.11□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF726P1Q15940 193 aa11.1□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-201ENST00000291574 Q0VG73 95 aa11.1□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-201ENST00000291574 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.1□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM168AQ92567 244 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 ESDP10768 282 aa11.09□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-201ENST00000291574 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A1W2PRX2 142 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 PSG3Q16557 428 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.09□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM249Q2WGJ8 235 aa11.09□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-201ENST00000291574 C10orf91Q5T1B1 145 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-201ENST00000291574 B3GALT5-AS1P59052 145 aa11.09□□□□□ -0.63
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TRAPPC10-201ENST00000291574 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 MYLKQ15746 1914 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM219Q86XT9 240 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF114Q8NC26 417 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.08□□□□□ -0.64
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TRAPPC10-201ENST00000291574 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 M0R2P5 195 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGLC2P0DOY2 106 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGLC3P0DOY3 106 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 HTN3P15516 51 aa11.07□□□□□ -0.64
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF876PQ49A33 203 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 CST9LQ9H4G1 147 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 TOMM40O96008 361 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 PF4P02776 101 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 CDPF1Q6NVV7 123 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 THADAQ6YHU6 1953 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM231BA6NCW3 169 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 SIGLEC9Q9Y336 463 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM178BH3BS89 294 aa11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV1-39P01597 117 aa11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV1D-39P04432 117 aa11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 BRWD3Q6RI45 1802 aa11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
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