RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 K7EM74 188 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 ERCC8Q13216 396 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 GNLYP22749 145 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 TAL2Q16559 108 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01545Q5VT33 79 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 SPXQ9BT56 116 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 PROK2Q9HC23 129 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 D6R8Y8 96 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 ELANEP08246 267 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 SS18Q15532 418 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 C14orf144Q96I85 54 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRB-201ENST00000261266 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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PTPRB-201ENST00000261266 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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PTPRB-201ENST00000261266 H3BUX3 64 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 VWC2Q2TAL6 325 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRB-201ENST00000261266 A0A087WV48 116 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 GGTLC3B5MD39 225 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 SAP30O75446 220 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRB-201ENST00000261266 S4R3C0 116 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF479Q96JC4 524 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 LEPROTO15243 131 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 MUC21Q5SSG8 566 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 C15orf65H3BRN8 121 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 GZMBP10144 247 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRB-201ENST00000261266 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM89A2RUT3 159 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 COL8A2P25067 703 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 RMI2Q96E14 147 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 SLAQ13239 276 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 GAGE13Q4V321 117 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRB-201ENST00000261266 H3BUT2 72 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 CD5LO43866 347 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV2-70P01814 119 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PPI3 338 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 J3QKU1 62 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 SAA4P35542 130 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 APOC4P55056 127 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 C20orf78Q9BR46 151 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 SIVA1O15304 175 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1B0GUS0 222 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 I3L3M4 83 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 KLRD1Q13241 179 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 H3BQ85 93 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 CD33P20138 364 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 MST1LQ2TV78 715 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 DPH3Q96FX2 82 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 CSTL1Q9H114 145 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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