RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 RMI1Q9H9A7 625 aa13.37□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 SLC40A1Q9NP59 571 aa13.37□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 HPCAL4Q9UM19 191 aa13.37□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 TOP1P11387 765 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 PDIA5Q14554 519 aa13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 SPATA21Q7Z572 469 aa13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 TPCN1Q9ULQ1 816 aa13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 ADCY9O60503 1353 aa13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 A6NNZ2 444 aa13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 CBFA2T2O43439 604 aa13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 GGCXP38435 758 aa13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 TUBB8Q3ZCM7 444 aa13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 AMOTQ4VCS5 1084 aa13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 TTLL7Q6ZT98 887 aa13.36□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 KIF1BO60333 1816 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 CD151P48509 253 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 UBASH3AP57075 661 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 KARSQ15046 597 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 KRT24Q2M2I5 525 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 CCDC13Q8IYE1 715 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 NUP133Q8WUM0 1156 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 TBC1D5Q92609 795 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 SDF4Q9BRK5 362 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 GRIN2DO15399 1336 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 OATP04181 439 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 PIP4K2BP78356 416 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 TSPAN18Q96SJ8 248 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 MEIS3Q99687 375 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 AGLP35573 1532 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 STX10O60499 249 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 FAM160A1Q05DH4 1040 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 GOLGA8FQ08AF8 430 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 DPCR1Q3MIW9 517 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM139Q8IV31 216 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 HOOK2Q96ED9 719 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 TSGA10Q9BZW7 698 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 MIS18AQ9NYP9 233 aa13.35□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 KIAA0232Q92628 1395 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 SERPINC1P01008 464 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 MCM3P25205 808 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 CFAP100Q494V2 611 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 COG1Q8WTW3 980 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 ZEB2O60315 1214 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 CYB5D1Q6P9G0 228 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 ACRBPQ8NEB7 543 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM165Q9HC07 324 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 SLC39A2Q9NP94 309 aa13.34□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.34□□□□□ -0.271e-18■■■■■ 447.2
SPIN3-241ENST00000640511 KIF5CO60282 957 aa13.33□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 DCTN1Q14203 1278 aa13.33□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 FAM228AQ86W67 206 aa13.33□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 YIPF3Q9GZM5 350 aa13.33□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 STAP2Q9UGK3 403 aa13.33□□□□□ -0.27
SPIN3-241ENST00000640511 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 CCDC148Q8NFR7 591 aa13.33□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 TM6SF1Q9BZW5 370 aa13.33□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP13.33□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 SLC30A9Q6PML9 568 aa13.33□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa13.33□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 MKL1Q969V6 931 aa13.33□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 CCDC114Q96M63 670 aa13.33□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 MBIPQ9NS73 344 aa13.33□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 AHCYL1O43865 530 aa13.32□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 VSTM4Q8IW00 320 aa13.32□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 ENGASEQ8NFI3 743 aa13.32□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 PFKFB2O60825 505 aa13.32□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 NCAPHQ15003 741 aa13.32□□□□□ -0.28
SPIN3-241ENST00000640511 ADCK5Q3MIX3 580 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms