RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630499.2

SRRM2-231, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRM2, Length 1,207 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-231	ENST00000630499	IRF6	O14896	467 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	FAM151A	Q8WW52	585 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	SIL1	Q9H173	461 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	PPIL2	Q13356	520 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	HOOK2	Q96ED9	719 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	NFIA	Q12857	509 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	COPRS	Q9NQ92	184 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SRRM2-231	ENST00000630499	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	BTBD19	C9JJ37	291 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	CETP	P11597	493 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	PHKA1	P46020	1223 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	DCAF15	Q66K64	600 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	DOCK2	Q92608	1830 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	TLR2	O60603	784 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	INPP5B	P32019	993 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	MEIS3	Q99687	375 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	AK9	Q5TCS8	1911 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	SEMA3E	O15041	775 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	PPAT	Q06203	517 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	SNAPC2	Q13487	334 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	ZNF333	Q96JL9	665 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	ADORA1	P30542	326 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	MOGS	Q13724	837 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	GAK	O14976	1311 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	TCP10	Q12799	353 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.03
SRRM2-231	ENST00000630499	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	MTX1	Q13505	466 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	CCDC102B	Q68D86	513 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	C17orf99	Q6UX52	265 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	IDI2	Q9BXS1	227 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	PTPRF	P10586	1907 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	RASGRF1	Q13972	1273 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	USP40	Q9NVE5	1235 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	CTGF	P29279	349 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	MAP3K10	Q02779	954 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	ARHGEF6	Q15052	776 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	TIMM10	P62072	90 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	CCER2	I3L3R5	266 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	ZNF384	Q8TF68	577 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	DOCK1	Q14185	1865 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	ENTPD3	O75355	529 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	RGS3	P49796	1198 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SRRM2-231	ENST00000630499	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	GNRH1	P01148	92 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	MGAM	O43451	1857 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499		A0A1B0GUL7	405 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	PDHX	O00330	501 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	TFCP2	Q12800	502 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	XAGE2	Q96GT9	111 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	GNAI3	P08754	354 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	NBPF11	Q86T75	865 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	TRIM47	Q96LD4	638 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	CPA4	Q9UI42	421 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	TNN	Q9UQP3	1299 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	CXCL11	O14625	94 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SRRM2-231	ENST00000630499	SLURP2	P0DP57	97 aa		27.6	■■■□□ 2.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms