RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 FNTAP49354 379 aa20.08■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 MYO1FO00160 1098 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 GUCY1B3Q02153 619 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 XAGE2Q96GT9 111 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 SLIT1O75093 1534 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 ABCC6O95255 1503 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 A0A1W2PQ27 194 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 A0A1W2PQ64 194 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 A0A1W2PQD8 194 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 MYL5Q02045 173 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZUG5 572 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 NBPF3Q9H094 633 aa20.08■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.07■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 A0A0D9SFI3 127 aa20.07■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 TC2NQ8N9U0 490 aa20.07■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 INTS13Q9NVM9 706 aa20.07■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 FANCLQ9NW38 375 aa20.07■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 NUTM2FA1L443 756 aa20.07■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 MTF1Q14872 753 aa20.07■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 WLSQ5T9L3 541 aa20.07■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.07■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 AP1ARQ63HQ0 302 aa20.07■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.06■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 IQCA1Q86XH1 822 aa20.06■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 KAT14Q9H8E8 782 aa20.06■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 TUBB4BP68371 445 aa20.06■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.06■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.06■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 PPFIA3O75145 1194 aa20.05■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF202O95125 648 aa20.05■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 OTUD6BQ8N6M0 293 aa20.05■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 GPATCH3Q96I76 525 aa20.05■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC175P0C221 793 aa20.05■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 ATP2B2Q01814 1243 aa20.05■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.05■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.05■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.05■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 FAM210AQ96ND0 272 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 A0A0U1RQJ8 604 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 HIP1O00291 1037 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 KIF5CO60282 957 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 CTAGE8P0CG41 777 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 IRAK1P51617 712 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 STK38Q15208 465 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.04■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 NEK1Q96PY6 1258 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 SH3GL3Q99963 347 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 EHD4Q9H223 541 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 MYBL2P10244 700 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 FOXO3O43524 673 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 CLSTN1O94985 981 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 TUBBP07437 444 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 COG3Q96JB2 828 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.03■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 ITSN1Q15811 1721 aa20.02■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 METP08581 1390 aa20.02■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 CTDNEP1O95476 244 aa20.02■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.02■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 SNRKQ9NRH2 765 aa20.02■□□□□ 0.8
GLIS1-202ENST00000628545 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.02■□□□□ 0.79
GLIS1-202ENST00000628545 FSBPO95073 299 aa20.02■□□□□ 0.79
GLIS1-202ENST00000628545 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
GLIS1-202ENST00000628545 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
GLIS1-202ENST00000628545 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.02■□□□□ 0.79
GLIS1-202ENST00000628545 CLIC4Q9Y696 253 aa20.02■□□□□ 0.79
GLIS1-202ENST00000628545 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms