RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPR25	O00155	361 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZBTB22	O15209	634 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	LDHC	P07864	332 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	GTF2A2	P52657	109 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	TCP10	Q12799	353 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	VGLL4	Q14135	290 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CETP	P11597	493 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCL15	Q16663	113 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	ENTPD3	O75355	529 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	POLA2	Q14181	598 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	GAK	O14976	1311 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	HMMR	O75330	724 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	GJA5	P36382	358 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	BTD	P43251	543 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	RGS3	P49796	1198 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	MECOM	Q03112	1051 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	PICALM	Q13492	652 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	BAG3	O95817	575 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	RLBP1	P12271	317 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPAT	Q06203	517 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	NFIA	Q12857	509 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	CRHR2	Q13324	411 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPIL2	Q13356	520 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	PANK1	Q8TE04	598 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGSF3	O75054	1194 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLCG2	P16885	1265 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	SP3	Q02447	781 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIF22	Q14807	665 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26

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