RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 PLCD1P51178 756 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 STX17P56962 302 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 DLGAP5Q15398 846 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 FNBP1Q96RU3 617 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 PPIP5K2O43314 1243 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
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CTDP1-208ENST00000613122 GPAA1O43292 621 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
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CTDP1-208ENST00000613122 A0A1W2PRG0 241 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC42Q96M95 316 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 MAPKBP1O60336 1514 aa22.74■■□□□ 1.23
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CTDP1-208ENST00000613122 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 SLC1A4P43007 532 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 PLCB3Q01970 1234 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 HSF2BPO75031 334 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 TCP10Q12799 353 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 SUCLG2Q96I99 432 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 IFT74Q96LB3 600 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 BIRC3Q13489 604 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 USP19O94966 1318 aa22.73■■□□□ 1.23
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CTDP1-208ENST00000613122 H7C1D1 291 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 WDR44Q5JSH3 913 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 RPS6KB1P23443 525 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 PRDM1O75626 825 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 KIF5AQ12840 1032 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 GCKRQ14397 625 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 ATP2A1O14983 1001 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 SYT1P21579 422 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 CHL1O00533 1208 aa22.72■■□□□ 1.23
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CTDP1-208ENST00000613122 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 CTAGE8P0CG41 777 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.72■■□□□ 1.23
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CTDP1-208ENST00000613122 ATL3Q6DD88 541 aa22.72■■□□□ 1.23
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CTDP1-208ENST00000613122 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R2P41236 205 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 STRN3Q13033 797 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 STK24Q9Y6E0 443 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 GPR162Q16538 588 aa22.7■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 MSL1Q68DK7 614 aa22.7■■□□□ 1.23
CTDP1-208ENST00000613122 SLC8A3P57103 927 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 CPXCR1Q8N123 301 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 SLC27A2O14975 620 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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CTDP1-208ENST00000613122 ADCY7P51828 1080 aa22.69■■□□□ 1.22
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CTDP1-208ENST00000613122 AZI2Q9H6S1 392 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 TYRO3Q06418 890 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 ELP1O95163 1332 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 KRT5P13647 590 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 PPM1EQ8WY54 764 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 NSMFQ6X4W1 530 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 USP26Q9BXU7 913 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 AOX1Q06278 1338 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 GINS2Q9Y248 185 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.68■■□□□ 1.22
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