RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608473.5

GTF3C2-AS1-211, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLC34A2O95436 690 aa10.8□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TEKT1Q969V4 418 aa10.8□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ELP3Q9H9T3 547 aa10.8□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa10.8□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAST3O60307 1309 aa10.8□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CACNA1FO60840 1977 aa10.79□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 E9PSI1 815 aa10.79□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PDE8BO95263 885 aa10.79□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PDE4AP27815 886 aa10.79□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GTF2A2P52657 109 aa10.79□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAP3K9P80192 1104 aa10.79□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 OPTNQ96CV9 577 aa10.79□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.79□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HDAC5Q9UQL6 1122 aa10.79□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SP3Q02447 781 aa10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EFCC1Q9HA90 598 aa10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UTYO14607 1347 aa10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLC5A1P13866 664 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BCAMP50895 628 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CRHR2Q13324 411 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCL15Q16663 113 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LRRC24Q50LG9 513 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DCAF15Q66K64 600 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 OTOP1Q7RTM1 612 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KAZALD1Q96I82 304 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KIF22Q14807 665 aa10.76□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.76□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 WDR66Q8TBY9 1149 aa10.76□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 OTUD5Q96G74 571 aa10.76□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MRIQ9BWK5 157 aa10.76□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SMC4Q9NTJ3 1288 aa10.76□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PTPN22Q9Y2R2 807 aa10.76□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AOX1Q06278 1338 aa10.76□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SSC5DA1L4H1 1573 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EYA2O00167 538 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CETPP11597 493 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GJA5P36382 358 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CACNB3P54284 484 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 VGLL4Q14135 290 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NBPF11Q86T75 865 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FAM83AQ86UY5 434 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ERO1BQ86YB8 467 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KLHDC4Q8TBB5 520 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SSH1Q8WYL5 1049 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LPIN2Q92539 896 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZDHHC15Q96MV8 337 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TEPSINQ96N21 525 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 WRNIP1Q96S55 665 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 USP44Q9H0E7 712 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SNAPC2Q13487 334 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ALDH1L2Q3SY69 923 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FKBP1CQ5VVH2 108 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HHIPL2Q6UWX4 724 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMC2Q8TDI7 906 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GCC1Q96CN9 775 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PTPN18Q99952 460 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF341Q9BYN7 854 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KIF16BQ96L93 1317 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.73□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GRIK5Q16478 980 aa10.73□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 VGLL2Q8N8G2 317 aa10.73□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BRI3BPQ8WY22 251 aa10.73□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.73□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF521Q96K83 1311 aa10.73□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa10.73□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LDHBP07195 334 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLFN5Q08AF3 891 aa10.72□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATP2B3Q16720 1220 aa10.72□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa10.72□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa10.72□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms