RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602056.1

GTPBP3-227, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-227	ENST00000602056	SLC34A2	O95436	690 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	ERO1B	Q86YB8	467 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	FAM151A	Q8WW52	585 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	IRF6	O14896	467 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	INPP5B	P32019	993 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	TCP10	Q12799	353 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	CCDC102B	Q68D86	513 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	HOOK2	Q96ED9	719 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	EFCC1	Q9HA90	598 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	ZBTB22	O15209	634 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	DCAF15	Q66K64	600 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	TNN	Q9UQP3	1299 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	BTBD19	C9JJ37	291 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	SEMA3E	O15041	775 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	TIMM10	P62072	90 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	HTT	P42858	3142 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	CETP	P11597	493 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	PPIL2	Q13356	520 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	USP40	Q9NVE5	1235 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GTPBP3-227	ENST00000602056	POTEF	A5A3E0	1075 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	MTX1	Q13505	466 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	RASGRF1	Q13972	1273 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	SRGAP3	O43295	1099 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	GNAI3	P08754	354 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	SNAPC2	Q13487	334 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	ARMC5	Q96C12	935 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	TRIM27	P14373	513 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	TFCP2	Q12800	502 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	BCAR3	O75815	825 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	PPAT	Q06203	517 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	GAK	O14976	1311 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056		A0A1B0GUL7	405 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	TLR2	O60603	784 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	XAGE2	Q96GT9	111 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GTPBP3-227	ENST00000602056	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	IDI2	Q9BXS1	227 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	RGS3	P49796	1198 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	MOGS	Q13724	837 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	ABCF2	Q9UG63	623 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	ZNF384	Q8TF68	577 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	SLURP2	P0DP57	97 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	ENTPD3	O75355	529 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	GNAI2	P04899	355 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	C17orf99	Q6UX52	265 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	ZNF333	Q96JL9	665 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	PI16	Q6UXB8	463 aa		28.77	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		28.77	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		28.77	■■■□□ 2.2
GTPBP3-227	ENST00000602056	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GTPBP3-227	ENST00000602056	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
GTPBP3-227	ENST00000602056	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
GTPBP3-227	ENST00000602056	BTD	P43251	543 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GTPBP3-227	ENST00000602056	MECOM	Q03112	1051 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GTPBP3-227	ENST00000602056	ARHGEF6	Q15052	776 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GTPBP3-227	ENST00000602056	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GTPBP3-227	ENST00000602056	PDHX	O00330	501 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GTPBP3-227	ENST00000602056	CTGF	P29279	349 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GTPBP3-227	ENST00000602056	MAP3K10	Q02779	954 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GTPBP3-227	ENST00000602056	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
GTPBP3-227	ENST00000602056	CPA4	Q9UI42	421 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GTPBP3-227	ENST00000602056	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		28.74	■■■□□ 2.19

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