RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598934.5

LINC00854-210, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 337 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-210	ENST00000598934	IMPDH2	P12268	514 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	SOX18	P35713	384 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	EVA1C	P58658	441 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PLAUR	Q03405	335 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	TCEA2	Q15560	299 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PSMD1	Q99460	953 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	GDF11	O95390	407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	BPNT1	O95861	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	EFHC2	Q5JST6	749 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	JAML	Q86YT9	394 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	STRN4	Q9NRL3	753 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934		A0A1W2PQH9	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PEX14	O75381	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	MAP3K6	O95382	1288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	NME2	P22392	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CNGA1	P29973	690 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	XP32	Q5T750	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	BHMT	Q93088	406 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	RBSN	Q9H1K0	784 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934		J3QW42	95 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	NRL	P54845	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	SIK1	P57059	783 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ATP11A	P98196	1134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	TNP2	Q05952	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	LRRC14	Q15048	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	TTC6	Q86TZ1	520 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CBX8	Q9HC52	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934		H3BM21	787 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ATE1	O95260	518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ARNT	P27540	789 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	RASSF7	Q02833	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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