RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591956.1

SNHG16-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

TSL 2

Gene SNHG16, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-208	ENST00000591956	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	ADM5	C9JUS6	153 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	ZAP70	P43403	619 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	RASA3	Q14644	834 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	HAUS7	Q99871	368 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	APBB1	O00213	710 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	BAG3	O95817	575 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	ECE1	P42892	770 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	ENTPD3	O75355	529 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	PLCG2	P16885	1265 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	MAP2K2	P36507	400 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.19
SNHG16-208	ENST00000591956	ERC2	O15083	957 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	IGHD	P01880	384 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	RHBDL3	P58872	404 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	AOX1	Q06278	1338 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	AOC2	O75106	756 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	HUNK	P57058	714 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	BTD	P43251	543 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	NUCB1	Q02818	461 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	GOLIM4	O00461	696 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	TBC1D12	O60347	775 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	NOG	Q13253	232 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	MX1	P20591	662 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	CYP7A1	P22680	504 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-208	ENST00000591956	NFIA	Q12857	509 aa		13.79	□□□□□ -0.2

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